RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 GNG5P63218 68 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 TEPPQ6URK8 271 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 Q6ZWC4 215 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 RNF2Q99496 336 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CALYQ9NYX4 217 aa7.3□□□□□ -1.24
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THBS3-201ENST00000368378 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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THBS3-201ENST00000368378 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 MOSP00540 346 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 FAM168AQ92567 244 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 PTTG1IPP53801 180 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 Q6ZT83 130 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.29□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 VAMP8Q9BV40 100 aa7.29□□□□□ -1.24
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THBS3-201ENST00000368378 TM4SF5O14894 197 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 OPRK1P41145 380 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 ATP6V1FQ16864 119 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 STUMQ69YW2 141 aa7.28□□□□□ -1.24
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THBS3-201ENST00000368378 WDR31Q8NA23 367 aa7.28□□□□□ -1.24
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THBS3-201ENST00000368378 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 NABP2Q9BQ15 211 aa7.28□□□□□ -1.24
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THBS3-201ENST00000368378 A0A1B0GW15 77 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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THBS3-201ENST00000368378 MMDQ15546 238 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 Q56UQ5 140 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 MUC21Q5SSG8 566 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CSTL1Q9H114 145 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.28□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 C20orf202A1L168 122 aa7.27□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 E7EUB6 86 aa7.27□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 WNT2P09544 360 aa7.27□□□□□ -1.24
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THBS3-201ENST00000368378 RELBQ01201 579 aa7.27□□□□□ -1.24
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THBS3-201ENST00000368378 KLK10O43240 276 aa7.27□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 SAP30O75446 220 aa7.27□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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THBS3-201ENST00000368378 TIGITQ495A1 244 aa7.27□□□□□ -1.25
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THBS3-201ENST00000368378 C15orf65H3BRN8 121 aa7.27□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 M0QZK8 103 aa7.27□□□□□ -1.25
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THBS3-201ENST00000368378 RPEL1Q2QD12 228 aa7.27□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.27□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.27□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 Q8N7P7 452 aa7.27□□□□□ -1.25
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THBS3-201ENST00000368378 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.27□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 HES4Q9HCC6 221 aa7.27□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 ZFHX3Q15911 3703 aa7.27□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.26□□□□□ -1.25
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THBS3-201ENST00000368378 SNAI2O43623 268 aa7.26□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 GCGP01275 180 aa7.26□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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THBS3-201ENST00000368378 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 OR4S2Q8NH73 311 aa7.26□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.26□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.26□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.26□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.26□□□□□ -1.25
THBS3-201ENST00000368378 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.26□□□□□ -1.25
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