RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR5B3Q8NH48 314 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF503Q96F45 646 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 K7EN84 100 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR7C2O60412 319 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CACNA1BQ00975 2339 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CGB1A6NKQ9 187 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ENSAO43768 121 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A17O43808 307 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR5I1Q13606 314 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C2orf83Q53S99 150 aa9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GUS0 222 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRYBB3P26998 211 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD69Q07108 199 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 K7ENP7 123 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LGALS4P56470 323 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM177Q53S58 311 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX38Q6PEX7 206 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR1P1Q8NH06 330 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.54□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VSTM5A8MXK1 200 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV2-23P01705 113 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMBPP02760 352 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DLX6P56179 175 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF90Q03938 601 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UHRF2Q96PU4 802 aa9.53□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.52□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNTFRP26992 372 aa9.52□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.52□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.52□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.52□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LY6HO94772 140 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HCP5Q6MZN7 132 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPIPB3Q92617 1050 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM186Q96B77 213 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NGBQ9NPG2 151 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GGTLC3B5MD39 225 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FNDC10F2Z333 226 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MT-CO2P00403 227 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TYMSP04818 313 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD99P14209 185 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM209BQ5JX69 171 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC35E1Q96K37 410 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PFDN5Q99471 154 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.52□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DLL1O00548 723 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL15P61313 204 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXL1Q12952 345 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDSNQ15517 529 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DMRT1Q9Y5R6 373 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PPI3 338 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIAH2O43255 324 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD3EP07766 207 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AREGP15514 252 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCN2P80188 198 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.51□□□□□ -0.89
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDPNQ86YL7 162 aa9.51□□□□□ -0.89
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