RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 SCAPERQ9BY12 1400 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR8D2Q9GZM6 311 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 DEFB127Q9H1M4 99 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 PPCSQ9HAB8 311 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 ACOT13Q9NPJ3 140 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 RHBDL2Q9NX52 303 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 IL36BQ9NZH7 164 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 MTFP1Q9UDX5 166 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 SCN11AQ9UI33 1791 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 PCTPQ9UKL6 214 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 POFUT2Q9Y2G5 429 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 ICOSQ9Y6W8 199 aa-2.04□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 WIZO95785 1651 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 DIP2AQ14689 1571 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 LOC100509620A0A075B734 347 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A096LNI7 61 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 SMIM26A0A096LP01 95 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR6C74A6NCV1 312 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 ANKDD1BA6NHY2 528 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR4C45A6NMZ5 311 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 J3KT08 172 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 M0R1B8 84 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TPST1O60507 370 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 KCNK2O95069 426 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 AHSA1O95433 338 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 DIRAS3O95661 229 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TCL1BO95988 128 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 LDHAP00338 332 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 CLEC3BP05452 202 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 ASAH2BP0C7U1 165 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 COX4I1P13073 169 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 GABRR2P28476 465 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 HRH1P35367 487 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 CD86P42081 329 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 NSG1P42857 185 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 DLX6P56179 175 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 RAB38P57729 211 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TPI1P60174 286 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 UBE2BP63146 152 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 GNA12Q03113 381 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 GABPAQ06546 454 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 HSPA14Q0VDF9 509 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 COQ5Q5HYK3 327 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 C9orf153Q5TBE3 101 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 HAUS3Q68CZ6 603 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 DUPD1Q68J44 220 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 SCIMPQ6UWF3 145 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 DPY19L4Q7Z388 723 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 ADCK2Q7Z695 626 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 CPLX4Q7Z7G2 160 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM86AQ8N2M4 240 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 ARHGAP18Q8N392 663 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR4M2Q8NGB6 313 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR10G3Q8NGC4 313 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR51D1Q8NGF3 324 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR8J1Q8NGP2 316 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR2G3Q8NGZ4 309 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR4L1Q8NH43 312 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR1L1Q8NH94 360 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR51E1Q8TCB6 317 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 UCMAQ8WVF2 138 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TWIST2Q8WVJ9 160 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 YIPF5Q969M3 257 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM45BQ96B21 275 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 FAM210AQ96ND0 272 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 PARD6BQ9BYG5 372 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 PRRG3Q9BZD7 231 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC5A7Q9GZV3 580 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 COMMD4Q9H0A8 199 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 NT5MQ9NPB1 228 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR2S2Q9NQN1 319 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 DMAC2Q9NW81 257 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 RAB20Q9NX57 234 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 STMN3Q9NZ72 180 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TBK1Q9UHD2 729 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 MOSPD1Q9UJG1 213 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 V9GY05 133 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 QSER1Q2KHR3 1735 aa-2.05□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 MAPKBP1O60336 1514 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 ABCC11Q96J66 1382 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A0G2JMP0 313 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 A0A1W2PQ09 198 aa-2.06□□□□□ -2.74
RNU6-540P-201ENST00000384622 TSPAN11A1L157 253 aa-2.06□□□□□ -2.74
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