RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 CENPXA8MT69 81 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 OR2J3O76001 311 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFB6O95139 128 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 OR13C7P0DN81 318 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLL1P15814 213 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB25P57735 213 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 Q6ZRM9 215 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 C1QL4Q86Z23 238 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC35G3Q8N808 338 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 NECAP1Q8NC96 275 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 HINT2Q9BX68 163 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC01619G3V211 115 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 DHFRP00374 187 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 OR8U8P0C7N1 319 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 DEFA4P12838 97 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 PRCDQ00LT1 54 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 C15orf32Q32M92 178 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM219AQ8IW50 185 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 DPF1Q92782 380 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 IL22RA2Q969J5 263 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.71□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 ST8SIA3O43173 380 aa8.71□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFB8O95169 186 aa8.71□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 TRBV12-3P01733 135 aa8.71□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 ANXA3P12429 323 aa8.71□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 SLURP1P55000 103 aa8.71□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP5G2Q06055 141 aa8.71□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP1R1AQ13522 171 aa8.71□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR146Q96CH1 333 aa8.71□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.71□□□□□ -1.01
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A0B4J2A0 478 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 SFT2D2O95562 160 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 VAMP1P23763 118 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 MFAP2P55001 183 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 AARDQ4LEZ3 155 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 SPINK9Q5DT21 86 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 NMSQ5H8A3 153 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 LGI3Q8N145 548 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 ENKURQ8TC29 256 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 DCUN1D4Q92564 292 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 CACNG5Q9UF02 275 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 IFNA17P01571 189 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 BCAP31P51572 246 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 SRPXP78539 464 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 OR2C3Q8N628 320 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 LRTM2Q8N967 370 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 CCDC140Q96MF4 163 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 S4R3C0 116 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 NOTCH1P46531 2555 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 OVOL1O14753 267 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHV3-23P01764 117 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF114Q8NC26 417 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 OR52E5Q8NH55 327 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 THYN1Q9P016 225 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 C9orf170A2RU37 121 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 BMPR1BO00238 502 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 CYB5BO43169 146 aa8.68□□□□□ -1.02
CCL3L3-201ENST00000612839 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms