RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 C16orf97H3BN30 126 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 ESDP10768 282 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 VN1R4Q7Z5H5 301 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 BIVMQ86UB2 503 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 FOXH1O75593 365 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 ATOH7Q8N100 152 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 GPR146Q96CH1 333 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 DUX3Q96PT4 197 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 CXCL10P02778 98 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 C1QTNF9P0C862 333 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS41Q7RTY9 318 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 RTN4RL2Q86UN3 420 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 GDF15Q99988 308 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 NCOR1O75376 2440 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 CTGFP29279 349 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 COL10A1Q03692 680 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 OR5P3Q8WZ94 311 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 JPT1Q9UK76 154 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 PSMB11A5LHX3 300 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 IGKCP01834 107 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 FBLN7Q53RD9 439 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 METTL12A8MUP2 240 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 IL11P20809 199 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 OR52E5Q8NH55 327 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV3-13P01766 116 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV3-7P01780 117 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV4-39P01824 125 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 GFRA1P56159 465 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 UBL5Q9BZL1 73 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 LIFP15018 202 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PR80 420 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 IGHMP01871 453 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 MIC13Q5XKP0 118 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 C1QL4Q86Z23 238 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF488Q96MN9 340 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 ERG28Q9UKR5 140 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 EPDR1Q9UM22 224 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRT-209ENST00000612229 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 RASL10BQ96S79 203 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM187Q14656 261 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 FOXQ1Q9C009 403 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 WDR82Q6UXN9 313 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 PCDH15Q96QU1 1955 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 FGFRL1Q8N441 504 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 C14orf144Q96I85 54 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN7P41732 249 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 LAGE3Q14657 143 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 FAM90A27PA6NNH2 459 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 CCL19Q99731 98 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 GCHFRP30047 84 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF479Q96JC4 524 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 J3KRW8 73 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 FXYD3Q14802 87 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 CACNA1HO95180 2353 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 GFRA3O60609 400 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 CD69Q07108 199 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 FUT5Q11128 374 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-209ENST00000612229 ZNHIT1O43257 154 aa5.95□□□□□ -1.46
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