RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560549.5

TMOD3-207, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMOD3, Length 1,474 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-207ENST00000560549 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 PSG2P11465 335 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 ZP3P21754 424 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 F2RP25116 425 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 CEACAM6P40199 344 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 CD200P41217 278 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 LPAR6P43657 344 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 ARHGDIBP52566 201 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 PAX9P55771 341 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 TMEM33P57088 247 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
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TMOD3-207ENST00000560549 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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TMOD3-207ENST00000560549 SSX9Q7RTT3 188 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa3.5□□□□□ -1.85
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TMOD3-207ENST00000560549 OR51H1Q8NH63 302 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 RFESDQ8TAC1 157 aa3.5□□□□□ -1.85
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TMOD3-207ENST00000560549 MRGPRDQ8TDS7 321 aa3.5□□□□□ -1.85
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TMOD3-207ENST00000560549 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.5□□□□□ -1.85
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TMOD3-207ENST00000560549 DUX4Q9UBX2 424 aa3.5□□□□□ -1.85
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TMOD3-207ENST00000560549 C15orf65H3BRN8 121 aa3.49□□□□□ -1.85
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TMOD3-207ENST00000560549 CHST1O43916 411 aa3.49□□□□□ -1.85
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TMOD3-207ENST00000560549 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
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TMOD3-207ENST00000560549 P0C879 139 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 PET100P0DJ07 73 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 ADCYAP1P18509 176 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 VDAC1P21796 283 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-207ENST00000560549 OMGP23515 440 aa3.48□□□□□ -1.85
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