RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTA-207ENST00000558936 DISC1C4P0D8 188 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 I3L2K1 104 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 PLA2G10O15496 165 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 ERVK-16P61578 105 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 PRCDQ00LT1 54 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 DHODHQ02127 395 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 MLANAQ16655 118 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV3-48P01763 117 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 CLEC3BP05452 202 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 CCR6P51684 374 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 OR5B3Q8NH48 314 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 GALNT14Q96FL9 552 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 OR4C12Q96R67 309 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 PRRT1Q99946 306 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 HINT2Q9BX68 163 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 COPZ2Q9P299 210 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 PRNDQ9UKY0 176 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 TENM3Q9P273 2699 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM213A2RRL7 107 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 S100GP29377 79 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 RPEL1Q2QD12 228 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 BSXQ3C1V8 233 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 NMSQ5H8A3 153 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF114Q8NC26 417 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 MCUBQ9NWR8 336 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF785A8K8V0 405 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 SNAPC5O75971 98 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 DHFRP00374 187 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 GPR183P32249 361 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 GPHB5Q86YW7 130 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC35G3Q8N808 338 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 B9D2Q9BPU9 175 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 C2orf70A6NJV1 201 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 LY86O95711 162 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 CTSGP08311 255 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 DEFA4P12838 97 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 IL7P13232 177 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 GP9P14770 177 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 S100A5P33763 92 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 TATDN3Q17R31 274 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 TRIM16LQ309B1 348 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 TM4SF20Q53R12 229 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM209BQ5JX69 171 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 OR1P1Q8NH06 330 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 OR4A16Q8NH70 328 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 TSC22D3Q99576 134 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 OR2T8A6NH00 312 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 LGALS9O00182 355 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 PITX3O75364 302 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 NXPH3O95157 252 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 C8orf88P0DMB2 117 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 AKR1C4P17516 323 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 ARL3P36405 182 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 IFITM3Q01628 133 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 PPP1R1AQ13522 171 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 CACNG5Q9UF02 275 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 MLXQ9UH92 298 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.52□□□□□ -0.89
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