RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 KIR2DS2P43631 304 aa8□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 RND3P61587 244 aa8□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 OR1L8Q8NGR8 309 aa8□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 PRNDQ9UKY0 176 aa8□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A0G2JRQ6 117 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 NDUFA2O43678 99 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CGAP01215 116 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CD1BP29016 333 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 TAS2R60P59551 318 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 ECSCRQ19T08 205 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 LYPD6Q86Y78 171 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 NAGKQ9UJ70 344 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 B4DEV8 164 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 C11orf94C9JXX5 98 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 M0R2Z0 102 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 SCGB2A1O75556 95 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 OR2J3O76001 311 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 OR5AL1P0C617 328 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 COX6B1P14854 86 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 HTR1DP28221 377 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 MSMPQ1L6U9 139 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 MIC13Q5XKP0 118 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 DPF1Q92782 380 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 RAB37Q96AX2 223 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 F2RL2O00254 374 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 NDUFS7O75251 213 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 IGLV1-44P01699 117 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 LIPFP07098 398 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 MYOD1P15172 320 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 PCSK4Q6UW60 755 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 OR1P1Q8NH06 330 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 NAT8Q9UHE5 227 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00473A8K010 186 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM178BH3BS89 294 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 SEC11BP0C7V7 166 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CT45A6P0DMU7 189 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CT45A5P0DMU8 189 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CT45A7P0DMV0 189 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CFPP27918 469 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6ZRM9 215 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CORO2AQ92828 525 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 FBXL15Q9H469 300 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 K7ERU9 68 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 SPCS3P61009 180 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 LYZP61626 148 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 LY6EQ16553 131 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PN81 502 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF738Q8NE65 137 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 C18orf12Q96KH6 178 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 RNF2Q99496 336 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 COA4Q9NYJ1 87 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 M0QZK8 103 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 KBTBD11O94819 623 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 C14orf144Q96I85 54 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CENPEQ02224 2701 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 PITX3O75364 302 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF137PP52743 207 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 ARL16Q0P5N6 197 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 CCL19Q99731 98 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 RPRMQ9NS64 109 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 PLXNB1O43157 2135 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 JMJD1CQ15652 2540 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRVP-201ENST00000482597 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms