RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 UCP1P25874 307 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 DEFA6Q01524 100 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 ZNF45Q02386 682 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 NECAP1Q8NC96 275 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 OR4A16Q8NH70 328 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 SEC22AQ96IW7 307 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 GPR132Q9UNW8 380 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 NOTCH1P46531 2555 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 A6NHS1 94 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 CYB5BO43169 146 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 IGKV1-5P01602 117 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 CRYGCP07315 174 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 CTRB1P17538 263 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 ZP3P21754 424 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 SLURP1P55000 103 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 DHODHQ02127 395 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 ATP5G2Q06055 141 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 BAK1Q16611 211 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 C15orf32Q32M92 178 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 TMEM56Q96MV1 263 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 DBX1A6NMT0 343 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 OVOL1O14753 267 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 P0C879 139 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 OR13C7P0DN81 318 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 ANXA3P12429 323 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 IL7P13232 177 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 AKR1C4P17516 323 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 SRPXP78539 464 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 WT1-ASQ06250 92 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 FAM209BQ5JX69 171 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 SLC35G3Q8N808 338 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 DCUN1D4Q92564 292 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 TMEM230Q96A57 120 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 CENPXA8MT69 81 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 CDS2O95674 445 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 TRBV12-3P01733 135 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 VAMP1P23763 118 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 PRCDQ00LT1 54 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 ZNF429Q86V71 674 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 FAM219AQ8IW50 185 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 IL22RA2Q969J5 263 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 GALNT14Q96FL9 552 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 BATF3Q9NR55 127 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 PRR13Q9NZ81 148 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 THYN1Q9P016 225 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
NELFE-214ENST00000625905 A0A0B4J293 547 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms