RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 OR2B8PP59922 312 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 NECAP1Q8NC96 275 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.67□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 CGB1A6NKQ9 187 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 CTDSPLO15194 276 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 DHFRP00374 187 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 TRBV12-3P01733 135 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 CD74P04233 296 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 REG1AP05451 166 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 PI3P19957 117 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 PSMB6P28072 239 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 PPP5CP53041 499 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 ACSM6Q6P461 480 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 SNAPC5O75971 98 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 CRYGCP07315 174 aa14.65□□□□□ -0.06
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SGMS1-208ENST00000608287 C15orf32Q32M92 178 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 TERB2Q8NHR7 220 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 OR4C12Q96R67 309 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-208ENST00000608287 FABP12A6NFH5 140 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 TNFSF8P32971 234 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 PIGPP57054 158 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 MEF2DQ14814 521 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 RPEL1Q2QD12 228 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 NSG2Q9Y328 171 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 SERPINE2P07093 398 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 SYNJ2BPP57105 145 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 RND3P61587 244 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 HINT2Q9BX68 163 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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SGMS1-208ENST00000608287 NDUFB8O95169 186 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 IGKV1-39P01597 117 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 IGKV1D-39P04432 117 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 AKAIN1P0CW23 69 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.073e-9■■■■□ 24.6
SGMS1-208ENST00000608287 TATDN3Q17R31 274 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 CADM3Q8N126 398 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 TSC22D3Q99576 134 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 COPZ2Q9P299 210 aa14.62□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 BMPR1BO00238 502 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 IGHV3-23P01764 117 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.61□□□□□ -0.07
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SGMS1-208ENST00000608287 SEC22AQ96IW7 307 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.61□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 PRNDQ9UKY0 176 aa14.61□□□□□ -0.07
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SGMS1-208ENST00000608287 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.6□□□□□ -0.07
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SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 H0Y980 276 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 OR13C7P0DN81 318 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 FAM209BQ5JX69 171 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 TP53RKQ96S44 253 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 SOSTQ9BQB4 213 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa14.6□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 C15orf61A6NNL5 157 aa14.59□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 PPP5D1E7EU14 171 aa14.59□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 S100A5P33763 92 aa14.59□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 WT1-ASQ06250 92 aa14.59□□□□□ -0.07
SGMS1-208ENST00000608287 KLK9Q2XQG4 91 aa14.59□□□□□ -0.07
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