RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554900.1

RPS6KL1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, human

TSL 5

Gene RPS6KL1, Length 445 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LFNG	Q8NES3	379 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ST8SIA3	O43173	380 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SPCS3	P61009	180 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OR1S1	Q8NH92	325 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ENY2	Q9NPA8	101 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TNC	P24821	2201 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TEX22	C9J3V5	150 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900		H3BUA1	57 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CYB5B	O43169	146 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SSNA1	O43805	119 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ADAP1	O75689	374 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	IGHG4	P01861	327 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OPN1MW	P04001	364 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ELANE	P08246	267 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CFHR3	Q02985	330 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900		Q6ZRM9	215 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TG	P01266	2768 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900		G3V318	75 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	LY86	O95711	162 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FOXE3	Q13461	319 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ALG5	Q9Y673	324 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PLXNB1	O43157	2135 aa		11.71	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900		E7EUB6	86 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PITX3	O75364	302 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MED6	O75586	246 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	BRI3	O95415	125 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CRYGC	P07315	174 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	MYOD1	P15172	320 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TNFRSF9	Q07011	255 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900		A0A1B0GW64	132 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	C5orf51	A6NDU8	294 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	HMX3	A6NHT5	357 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	FBXO24	O75426	580 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	IGLV1-40	P01703	118 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OR13C7	P0DN81	318 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PSMB6	P28072	239 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	TMEM65	Q6PI78	240 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ZNF329	Q86UD4	541 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	RNF152	Q8N8N0	203 aa		11.69	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	WRB	O00258	174 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CCS	O14618	274 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	GOSR2	O14653	212 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	APELA	P0DMC3	54 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PF4V1	P10720	104 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	DEFA4	P12838	97 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	AREG	P15514	252 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CTRB1	P17538	263 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	PSMB8	P28062	276 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	OR2C3	Q8N628	320 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RPS6KL1-208	ENST00000554900	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms