RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	LINC01619	G3V211	115 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SNAPC5	O75971	98 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	OR2J3	O76001	311 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TRBV12-3	P01733	135 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	DCUN1D4	Q92564	292 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	USMG5	Q96IX5	58 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	PRND	Q9UKY0	176 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		18.63	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	C15orf61	A6NNL5	157 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	OR8U8	P0C7N1	319 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	WT1-AS	Q06250	92 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	KLK9	Q2XQG4	91 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TRIM16L	Q309B1	348 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897		A0A0G2JRQ6	117 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	NDUFB8	O95169	186 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TSC22D3	Q99576	134 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	HINT2	Q9BX68	163 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	PRR13	Q9NZ81	148 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897		A0A0B4J293	547 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM223B	A6NKX1	122 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	CDS2	O95674	445 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	ATP5G2	Q06055	141 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	NECAP1	Q8NC96	275 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	OR4A16	Q8NH70	328 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	B3GALNT1	O75752	331 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	OR13C7	P0DN81	318 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	KRTAP10-11	P60412	298 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	C15orf32	Q32M92	178 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	TRIQK	Q629K1	86 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TPCN1-222	ENST00000552897	IL7	P13232	177 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	AKR1C4	P17516	323 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	AKR1C2	P52895	323 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM187	Q14656	261 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897		Q6ZRM9	215 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	OR5B3	Q8NH48	314 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897		S4R3C0	116 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	CCR6	P51684	374 aa		18.57	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	MFAP2	P55001	183 aa		18.57	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	DHODH	Q02127	395 aa		18.57	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		18.57	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	GALNT14	Q96FL9	552 aa		18.57	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM56	Q96MV1	263 aa		18.57	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		18.57	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		18.56	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	OVOL1	O14753	267 aa		18.56	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	IGHV3-23	P01764	117 aa		18.56	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	DEFA4	P12838	97 aa		18.56	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		18.56	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	WIPF1	O43516	503 aa		18.55	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	INPP1	P49441	399 aa		18.55	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	SPINK9	Q5DT21	86 aa		18.55	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		18.55	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF429	Q86V71	674 aa		18.55	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		18.54	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	BMPR1B	O00238	502 aa		18.54	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	ST8SIA3	O43173	380 aa		18.54	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	ATG12	O94817	140 aa		18.54	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	DHFR	P00374	187 aa		18.54	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	BTC	P35070	178 aa		18.54	■□□□□ 0.56
TPCN1-222	ENST00000552897	PRCD	Q00LT1	54 aa		18.54	■□□□□ 0.56

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