RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 WDR86Q86TI4 376 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 UHRF2Q96PU4 802 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 ESDP10768 282 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 PCBD1P61457 104 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 LCN12Q6JVE5 192 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 SARAFQ96BY9 339 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.56□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 GPX1P07203 203 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 TCL1AP56279 114 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZN92 141 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 STARD4Q96DR4 205 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 DNPH1O43598 174 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 FOXH1O75593 365 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 IGLC2P0DOY2 106 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 IGLC3P0DOY3 106 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 AMTP48728 403 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 LGALS4P56470 323 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 VWC2Q2TAL6 325 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 VHLLQ6RSH7 139 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 GFRALQ6UXV0 394 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 NRN1Q9NPD7 142 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 IL36BQ9NZH7 164 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PPV4 95 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 LINC00473A8K010 186 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 PTTG1IPP53801 180 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 FXYD3Q14802 87 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 TXN2Q99757 166 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 VPS13CQ709C8 3753 aa7.55□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 FLNCQ14315 2725 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 TACC2O95359 2948 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 C20orf202A1L168 122 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 ZNF83P51522 516 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 BPIFB3P59826 476 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 RANP62826 216 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 ATP6V1FQ16864 119 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 LYG1Q8N1E2 194 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 MGST2Q99735 147 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PS18 150 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 PSPNO60542 156 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 OR9G9P0C7N8 305 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 C3orf79P0CE67 100 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 CD1BP29016 333 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 CDSNQ15517 529 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 MMD2Q8IY49 270 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 TMEM45BQ96B21 275 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 CENPEQ02224 2701 aa7.54□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 LRP5LA4QPB2 252 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 AARDQ4LEZ3 155 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 NIT1Q86X76 327 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 V9GYV3 84 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 C12orf77C9JDV5 145 aa7.53□□□□□ -1.2
THBS3-211ENST00000541990 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms