RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 RHOGP84095 191 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 DEFA6Q01524 100 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM16LQ309B1 348 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIQKQ629K1 86 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 OR5B3Q8NH48 314 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.68□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 ATG12O94817 140 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 DHFRP00374 187 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 IGKV1-5P01602 117 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 REG1AP05451 166 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 INPP1P49441 399 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 AKR1C2P52895 323 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 KLK9Q2XQG4 91 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 NECAP1Q8NC96 275 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM230Q96A57 120 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.67□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 DBX1A6NMT0 343 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 OR2J3O76001 311 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 P0C879 139 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 SLURP1P55000 103 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 DHODHQ02127 395 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 OR4A16Q8NH70 328 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 CDS2O95674 445 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP5G2Q06055 141 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 DCUN1D4Q92564 292 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 GALNT14Q96FL9 552 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 HINT2Q9BX68 163 aa14.65□□□□□ -0.06
PACSIN3-208ENST00000531226 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 DEFA4P12838 97 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 WT1-ASQ06250 92 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 C15orf32Q32M92 178 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM56Q96MV1 263 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.64□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 OVOL1O14753 267 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 OR13C7P0DN81 318 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 IL7P13232 177 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 AKR1C4P17516 323 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 ZP3P21754 424 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF429Q86V71 674 aa14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0G2JRQ6 117 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 WIPF1O43516 503 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 NDUFB8O95169 186 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 TRBV12-3P01733 135 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 PRCDQ00LT1 54 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM187Q14656 261 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM209BQ5JX69 171 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 C9orf66Q5T8R8 295 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM219AQ8IW50 185 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 BATF3Q9NR55 127 aa14.62□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0B4J293 547 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 IL22RA2Q969J5 263 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-208ENST00000531226 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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