RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529998.5

UBASH3B-205, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 698 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-205ENST00000529998 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 IGLL1P15814 213 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 CTRB1P17538 263 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 CD33P20138 364 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 PSMB6P28072 239 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 FHL3Q13643 280 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM187Q14656 261 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TRIM16LQ309B1 348 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 C1QL4Q86Z23 238 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 OR4A16Q8NH70 328 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TSC22D3Q99576 134 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 HINT2Q9BX68 163 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 PRNDQ9UKY0 176 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 NOTCH1P46531 2555 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 A0A087WW49 117 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 A0A0B4J293 547 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 A0A0G2JLM5 398 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 OR2J3O76001 311 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 BTCP35070 178 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 AKR1C2P52895 323 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 RAB25P57735 213 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 RHOGP84095 191 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 DHODHQ02127 395 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 WT1-ASQ06250 92 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF616Q08AN1 781 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 Q6ZRM9 215 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 S100ZQ8WXG8 99 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 GALNT14Q96FL9 552 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM56Q96MV1 263 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM223BA6NKX1 122 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 CENPXA8MT69 81 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 ATG12O94817 140 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 NDUFB6O95139 128 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 NDUFB8O95169 186 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TRBV12-3P01733 135 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 OR13C7P0DN81 318 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 SLURP1P55000 103 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 ATP5G2Q06055 141 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 KLK9Q2XQG4 91 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF429Q86V71 674 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 NECAP1Q8NC96 275 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 OR5B3Q8NH48 314 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 DPF1Q92782 380 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 GPR146Q96CH1 333 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 USMG5Q96IX5 58 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 CCDC32Q9BV29 185 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 LINC01619G3V211 115 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 ST8SIA3O43173 380 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 LYRM1O43325 122 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 OR8U8P0C7N1 319 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 DEFA4P12838 97 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 MFAP2P55001 183 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 PRCDQ00LT1 54 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 PPP1R1AQ13522 171 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 C15orf32Q32M92 178 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-205ENST00000529998 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms