RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496277.5

CNIH3-211, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene CNIH3, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-211ENST00000496277 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TPRP12270 2363 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 A0A0A6YYD4 124 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 DPRXA6NFQ7 191 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 H7C417 338 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 MFNGO00587 321 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 LYRM1O43325 122 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 ORC5O43913 435 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 IGKV1D-12P01611 117 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TCRBP04435 133 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 CD200P41217 278 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 FABP6P51161 128 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 GPM6AP51674 278 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 FGF12P61328 243 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SRPXP78539 464 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 OR5I1Q13606 314 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 OR8G1Q15617 311 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 NCMAPQ5T1S8 102 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 OR10K2Q6IF99 312 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SLC25A26Q70HW3 274 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 GDPD3Q7L5L3 318 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TMED4Q7Z7H5 227 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 LINC00596Q86U02 117 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 CALHM1Q8IU99 346 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 Q8IYB0 196 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TOMM5Q8N4H5 51 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 OR51T1Q8NGJ9 327 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 OR8S1Q8NH09 359 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 OR51F2Q8NH61 342 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 RAB3CQ96E17 227 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SEH1LQ96EE3 360 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SELENOIQ9C0D9 397 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 ARL6Q9H0F7 186 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 OR51I2Q9H344 312 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 RBKSQ9H477 322 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 KCNJ16Q9NPI9 418 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 COPZ2Q9P299 210 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 MTFP1Q9UDX5 166 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 ANAPC10Q9UM13 185 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SVILO95425 2214 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 ITPR1Q14643 2758 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SHANK1Q9Y566 2161 aa3□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 ASPMQ8IZT6 3477 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 USP24Q9UPU5 2620 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 FAM231BA6NCW3 169 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TRDCB7Z8K6 153 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 J3QT63 122 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 K7EQG2 157 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 HSD17B6O14756 317 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SIGLEC5O15389 551 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SOCS1O15524 211 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TNFSF12O43508 249 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SYNGR1O43759 233 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 ANGPTL7O43827 346 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 PDCD6O75340 191 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 HBE1P02100 147 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 CD74P04233 296 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 CD55P08174 381 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 AKAIN1P0CW23 69 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 PGA5P0DJD9 388 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TBPP20226 339 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SERPINA2P20848 420 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 FUT3P21217 361 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SLC6A1P30531 599 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 RCVRNP35243 200 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 FAUP35544 74 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 SRP9P49458 86 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 RBM11P57052 281 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 GNG2P59768 71 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 RPL19P84098 196 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 BSPH1Q075Z2 132 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TFF3Q07654 80 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 MPV17LQ2QL34 196 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 TMEM255AQ5JRV8 349 aa2.99□□□□□ -1.93
CNIH3-211ENST00000496277 ACTL10Q5JWF8 245 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms