RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ATP5G2	Q06055	141 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	FHL3	Q13643	280 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	TG	P01266	2768 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	FAM223B	A6NKX1	122 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	OR5AC1	P0C628	307 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	ZNF45	Q02386	682 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USP19-210	ENST00000465902	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	B3GALNT1	O75752	331 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	FGF2	P09038	288 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	AKR1C4	P17516	323 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	BAK1	Q16611	211 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	CADM3	Q8N126	398 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	NECAP1	Q8NC96	275 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	DCUN1D4	Q92564	292 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	OVOL1	O14753	267 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1-5	P01602	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	CRYGC	P07315	174 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	CTRB1	P17538	263 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	UCP1	P25874	307 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	C15orf32	Q32M92	178 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	OR5B3	Q8NH48	314 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902		A6NHS1	94 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	DHODH	Q02127	395 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	CYB5B	O43169	146 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	NDUFB8	O95169	186 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-23	P01764	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	ZP3	P21754	424 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	WT1-AS	Q06250	92 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902		S4R3C0	116 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	CDS2	O95674	445 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	IFNA17	P01571	189 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	TMEM230	Q96A57	120 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	PRR13	Q9NZ81	148 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	THYN1	Q9P016	225 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	CENPX	A8MT69	81 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	ANXA3	P12429	323 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	IL7	P13232	177 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	CCR6	P51684	374 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	SPINK9	Q5DT21	86 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP19-210	ENST00000465902		A0A0B4J293	547 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP19-210	ENST00000465902	SAP30	O75446	220 aa		13.64	□□□□□ -0.23

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