RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM177Q53S58 311 aa20.54■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 NAT8Q9UHE5 227 aa20.54■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 S100A6P06703 90 aa20.54■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 CXCL1P09341 107 aa20.54■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 COL8A2P25067 703 aa20.54■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDSNQ15517 529 aa20.54■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR5B3Q8NH48 314 aa20.54■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 NABP2Q9BQ15 211 aa20.54■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 IGHV1-8P0DP01 117 aa20.53■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPS10P46783 165 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 B2MP61769 119 aa20.53■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADORA2A-AS1P86434 159 aa20.53■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM71F2Q6NXP2 309 aa20.53■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR9G1Q8NH87 305 aa20.53■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa20.53■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 PARLQ9H300 379 aa20.53■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNIP2Q9NS61 270 aa20.53■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM241Q24JQ0 296 aa20.52■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa20.52■□□□□ 0.88
PLEKHF1-201ENST00000436066 C11orf94C9JXX5 98 aa20.52■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR4C13Q8NGP0 309 aa20.52■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A087X0M5 115 aa20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A1B0GX30 115 aa20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAB31Q13636 194 aa20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 ADIRFQ15847 76 aa20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM249Q2WGJ8 235 aa20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDPNQ86YL7 162 aa20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 C11orf42Q8N5U0 333 aa20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR10W1Q8NGF6 305 aa20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 COMMD5Q9GZQ3 224 aa20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM242Q9NWH2 141 aa20.51■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 IGFBP2P18065 325 aa20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 UBE2G2P60604 165 aa20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 STPG3Q8N7X2 389 aa20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM122AQ96E09 287 aa20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 CLDN34H7C241 214 aa20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPL8P62917 257 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 C1QL4Q86Z23 238 aa20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 ABHD5Q8WTS1 349 aa20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPTA1P02549 2419 aa20.5■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 C5orf52A6NGY3 159 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 FNDC10F2Z333 226 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 STAG3L2P0CL84 134 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 STAG3L3P0CL85 134 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARL14EPLP0DKL9 152 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 C2orf83Q53S99 150 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM133Q9H2Q1 129 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 USF1P22415 310 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPL29P47914 159 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF137PP52743 207 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 MOB3BQ86TA1 216 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 WASHC3Q9Y3C0 194 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 TNCP24821 2201 aa20.49■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 RELNP78509 3460 aa20.48■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 BSXQ3C1V8 233 aa20.48■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 CST9LP1Q5W188 147 aa20.48■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPNS3Q6ZMD2 512 aa20.48■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 CXorf1O96002 111 aa20.47■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 RPL23P62829 140 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR1L8Q8NGR8 309 aa20.47■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 VSTM2AQ8TAG5 236 aa20.47■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa20.47■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 SSX3Q99909 188 aa20.47■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP5G3P48201 142 aa20.47■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 RND2P52198 227 aa20.47■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 E7EUB6 86 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 NPPCP23582 126 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 DLX1P56177 255 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF841Q6ZN19 808 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR4A5Q8NH83 315 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCGF1Q9BSM1 259 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 CTDSP1Q9GZU7 261 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 IGLV2-23P01705 113 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 IGHV2-70P01814 119 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 IL3RAP26951 378 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRR20EP86478 221 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRR20CP86479 221 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRR20DP86480 221 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRR20BP86481 221 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRR20AP86496 221 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM144Q7Z5S9 345 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR51G1Q8NGK1 321 aa20.46■□□□□ 0.87
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDE6DO43924 150 aa20.45■□□□□ 0.86
PLEKHF1-201ENST00000436066 RHOBP62745 196 aa20.45■□□□□ 0.86
PLEKHF1-201ENST00000436066 ERHP84090 104 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PLEKHF1-201ENST00000436066 MLANAQ16655 118 aa20.45■□□□□ 0.86
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa20.45■□□□□ 0.86
PLEKHF1-201ENST00000436066 MC5RP33032 325 aa20.44■□□□□ 0.86
PLEKHF1-201ENST00000436066 GAMTQ14353 236 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms