RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 CST9LP1Q5W188 147 aa21.57■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 LINC00469Q8N7U9 141 aa21.57■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 LINC00574Q9H8X3 128 aa21.57■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 TMEM14BQ9NUH8 114 aa21.57■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 MT-CO2P00403 227 aa21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 RPL29P47914 159 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 REC114Q7Z4M0 266 aa21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 ZNF843Q8N446 348 aa21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 NUP37Q8NFH4 326 aa21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 RND1Q92730 232 aa21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 SDSLQ96GA7 329 aa21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 OR2V2Q96R30 315 aa21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 NDUFB4O95168 129 aa21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 RPL15P61313 204 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 C17orf58Q2M2W7 97 aa21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 GCSAMLQ5JQS6 135 aa21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 SSX9Q7RTT3 188 aa21.56■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa21.55■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 RHOBP62745 196 aa21.55■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 C11orf52Q96A22 123 aa21.55■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 TMEM18Q96B42 140 aa21.55■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 FAM234AQ9H0X4 552 aa21.55■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 ARL14EPLP0DKL9 152 aa21.54■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 NPY1RP25929 384 aa21.54■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 IL3RAP26951 378 aa21.54■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 SSX2Q16385 188 aa21.54■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 TEPPQ6URK8 271 aa21.54■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 FUT9Q9Y231 359 aa21.54■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 THBDP07204 575 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 GZMBP10144 247 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 AREGP15514 252 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 MIC13Q5XKP0 118 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 TMEM108Q6UXF1 575 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 MOGAT3Q86VF5 341 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 SLC24A4Q8NFF2 622 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 SFRP2Q96HF1 295 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 ENY2Q9NPA8 101 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 DDTP30046 118 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 CHRNA7P36544 502 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 CNN1P51911 297 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 CT45A1Q5HYN5 189 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 FAM78BQ5VT40 261 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 VHLLQ6RSH7 139 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 ABHD12Q8N2K0 398 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 CT45A3Q8NHU0 189 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 PRNDQ9UKY0 176 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa21.53■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 TRAV3A0A0B4J244 114 aa21.52■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 GCHFRP30047 84 aa21.52■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 UBE2G2P60604 165 aa21.52■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 ZNF439Q8NDP4 499 aa21.52■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 C1orf159Q96HA4 380 aa21.52■■□□□ 1.04
TPI1-201ENST00000229270 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 C9JCJ5 164 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 DEFA4P12838 97 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 SELENOVP59797 346 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 ZNRF1Q8ND25 227 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 TMEM37Q8WXS4 190 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 RHOVQ96L33 236 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 RNF7Q9UBF6 113 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 SLC31A2O15432 143 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 OR4A47Q6IF82 309 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 NEUROG1Q92886 237 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 C14orf144Q96I85 54 aa21.51■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 NBASA2RRP1 2371 aa21.5■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 DPRXA6NFQ7 191 aa21.5■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 RD3LP0DJH9 198 aa21.5■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 WFDC8Q8IUA0 241 aa21.5■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa21.5■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 ITLN1Q8WWA0 313 aa21.5■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 UHRF2Q96PU4 802 aa21.5■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa21.5■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 CA7P43166 264 aa21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 PRR20EP86478 221 aa21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 PRR20CP86479 221 aa21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 PRR20DP86480 221 aa21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 PRR20BP86481 221 aa21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 PRR20AP86496 221 aa21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 EFNB3Q15768 340 aa21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 STUMQ69YW2 141 aa21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 IL19Q9UHD0 177 aa21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa21.49■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa21.48■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 A0A0U1RQK1 487 aa21.48■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 ZNF320A2RRD8 509 aa21.48■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 CASP6P55212 293 aa21.48■■□□□ 1.03
TPI1-201ENST00000229270 PNKDQ8N490 385 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms