RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CT45A1Q5HYN5 189 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CT45A3Q8NHU0 189 aa20.8■□□□□ 0.92
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CAPNS1-204ENST00000587718 COLCA2A8K830 154 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 C17orf112F2Z3M2 114 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 MPDU1O75352 247 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR8G2PQ6IF36 304 aa20.79■□□□□ 0.92
CAPNS1-204ENST00000587718 CLEC2AQ6UVW9 174 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-204ENST00000587718 RPS10P5Q9NQ39 176 aa20.79■□□□□ 0.92
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CAPNS1-204ENST00000587718 C8orf31Q8N9H6 132 aa20.76■□□□□ 0.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM249Q2WGJ8 235 aa20.76■□□□□ 0.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 SAP30LQ9HAJ7 183 aa20.75■□□□□ 0.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 PPIAL4DF5H284 164 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM178BH3BS89 294 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC31A2O15432 143 aa20.74■□□□□ 0.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa20.74■□□□□ 0.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 PPIAL4AQ9Y536 164 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa20.74■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 DSCAML1Q8TD84 2053 aa20.74■□□□□ 0.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFA2O43678 99 aa20.73■□□□□ 0.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM216BQ8N7L0 139 aa20.73■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 RXFP4Q8TDU9 374 aa20.73■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 KAAG1Q9UBP8 84 aa20.73■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 TANC2Q9HCD6 1990 aa20.73■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 VWC2LB2RUY7 222 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 B9A039 149 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 FNDC10F2Z333 226 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 FSTL3O95633 263 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2B8PP59922 312 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 HEPN1Q6WQI6 88 aa20.72■□□□□ 0.91
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