RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 DPF1Q92782 380 aa16.18■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 V9GYH0 126 aa16.18■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 A0A087WW49 117 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 KRASP01116 189 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 PRH1P02810 166 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 AKAIN1P0CW23 69 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 G6PCP35575 357 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 PIGPP57054 158 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 RND3P61587 244 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 TTC9CQ8N5M4 171 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 OR13C8Q8NGS7 320 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 MRGPRFQ96AM1 343 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 GPR61Q9BZJ8 451 aa16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 A0A0G2JLM5 398 aa16.16■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa16.16■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 CGB1A6NKQ9 187 aa16.16■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 DISC1C4P0D8 188 aa16.16■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 LINC01619G3V211 115 aa16.16■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 OR2B8PP59922 312 aa16.16■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.16■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 FGF2P09038 288 aa16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 AREGP15514 252 aa16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 SLURP1P55000 103 aa16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF45Q02386 682 aa16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 PYDC2Q56P42 97 aa16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 C19orf35Q6ZS72 473 aa16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC190Q86UF4 302 aa16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 SLC25A42Q86VD7 318 aa16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 ZFAND1Q8TCF1 268 aa16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 COMMD5Q9GZQ3 224 aa16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa16.15■□□□□ 0.18
TMOD3-203ENST00000558455 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa16.14■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 DPPA5A6NC42 116 aa16.14■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 NPIPB5A8MRT5 1133 aa16.14■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 IGKV1-39P01597 117 aa16.14■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 IGKV1D-39P04432 117 aa16.14■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.174e-13■■■■■ 49
TMOD3-203ENST00000558455 RHOGP84095 191 aa16.14■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF79Q15937 498 aa16.14■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 CADM3Q8N126 398 aa16.14■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 USMG5Q96IX5 58 aa16.14■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 AKIP1Q9NQ31 210 aa16.14■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 FAM223BA6NKX1 122 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 H0Y980 276 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 SERPINE2P07093 398 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 FAM223AQ8IWN6 122 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 OR51S1Q8NGJ8 323 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 DCUN1D4Q92564 292 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM63Q969Q1 353 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 SEC22AQ96IW7 307 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 TP53RKQ96S44 253 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 PRRT1Q99946 306 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 COPZ2Q9P299 210 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 NSG2Q9Y328 171 aa16.13■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 IGLC7A0M8Q6 106 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD34BA5PLL1 514 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 SEC14L6B5MCN3 397 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 REG1AP05451 166 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 CRYGCP07315 174 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 PSMB6P28072 239 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 ECI1P42126 302 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 KRTAP10-11P60412 298 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF343Q6P1L6 599 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 Q8N402 240 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 NDUFA13Q9P0J0 144 aa16.12■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 SNAPC5O75971 98 aa16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 OR2J3O76001 311 aa16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 CTRB1P17538 263 aa16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 CTRB2Q6GPI1 263 aa16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 REC114Q7Z4M0 266 aa16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 NECAP1Q8NC96 275 aa16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 MCUBQ9NWR8 336 aa16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 SLC2A8Q9NY64 477 aa16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 OVOL1O14753 267 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 TRBV12-3P01733 135 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 ETV6P41212 452 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 ATP5G2Q06055 141 aa16.1■□□□□ 0.17
TMOD3-203ENST00000558455 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms