RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 OR5H14A6NHG9 310 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 MSGN1A6NI15 193 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 SNRPGP15A8MWD9 76 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR11H12B2RN74 326 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 SMLR1H3BR10 107 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR4E1P0C645 316 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ZP3P21754 424 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF137PP52743 207 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 TSPAN5P62079 268 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 PAX5Q02548 391 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 MMDQ15546 238 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ECSCRQ19T08 205 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 C4orf46Q504U0 113 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 IGSF11Q5DX21 431 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 TERB2Q8NHR7 220 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM230Q96A57 120 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 Q9N2K0 584 aa5.4□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 FAT1Q14517 4588 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 RTL8CO15255 209 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 SLC31A2O15432 143 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 FABP7O15540 132 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 NDUFB8O95169 186 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 GLAP06280 429 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 SCTP09683 121 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 AKR1C4P17516 323 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 PI3P19957 117 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 ZBTB25P24278 435 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 FCGR2CP31995 323 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 SYNJ2BPP57105 145 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 DHRS2Q13268 280 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R1AQ13522 171 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 ZFP69Q49AA0 526 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 LIN54Q6MZP7 749 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF880Q6PDB4 577 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 Q6ZS49 121 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM17Q86X19 198 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF575Q86XF7 245 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 GAPTQ8N292 157 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 NPBQ8NG41 125 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 OR52M1Q8NGK5 317 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC107Q8WV48 283 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 MS4A10Q96PG2 267 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 GPR132Q9UNW8 380 aa5.39□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 C9orf170A2RU37 121 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 TRDCB7Z8K6 153 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 G3V3Q6 166 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 C15orf65H3BRN8 121 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 TXNL1O43396 289 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 NDUFA3O95167 84 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 SIX6O95475 246 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 ANXA3P12429 323 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 AADACP22760 399 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 IL3RAP26951 378 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF134P52741 427 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 TPPP2P59282 170 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 FXYD4P59646 89 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 HLA-DRB3P79483 266 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 DHODHQ02127 395 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 OR2AK2Q8NG84 335 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 PRR13Q9NZ81 148 aa5.38□□□□□ -1.55
CASQ1-203ENST00000481081 PIPOXQ9P0Z9 390 aa5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms