RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 LURAP1Q96LR2 239 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 RNF167Q9H6Y7 350 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 IL24Q13007 206 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 C1QL2Q7Z5L3 287 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 HSF4Q9ULV5 492 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 HTTP42858 3142 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 FRMPD3Q5JV73 1810 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 RP1P56715 2156 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SCN1AP35498 2009 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TRGC2P03986 189 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 IGSF11Q5DX21 431 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CBLN3Q6UW01 205 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ZNF525Q8N782 197 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 LEAP2Q969E1 77 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ZNF488Q96MN9 340 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 A6NDN8 102 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 PRCDQ00LT1 54 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CXCL16Q9H2A7 254 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 LRRC37A2A6NM11 1700 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 FAM186AA6NE01 2351 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 NLRC5Q86WI3 1866 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 AGAP20933 346 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 OVOL1O14753 267 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 PAGE4O60829 102 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SIX6O95475 246 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CD160O95971 181 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CD3DP04234 171 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 DEFB130BP0DP73 79 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 DEFB130AP0DP74 79 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TCL1AP56279 114 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 RNF144BQ7Z419 303 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ZNF253O75346 499 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CD74P04233 296 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 DEFA6Q01524 100 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 AANATQ16613 207 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 PIGYQ3MUY2 71 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ZNF721Q8TF20 911 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 LINC00470Q9BZP3 86 aa3.49□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 GAGE10A6NGK3 116 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 IGHV3-53P01767 116 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 COX5BP10606 129 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TCTAP57738 103 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 FAM27BQ5VT28 67 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 DLEU7Q6UYE1 221 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 MZB1Q8WU39 189 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 VCX2Q9H322 139 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 PPYP01298 95 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 LHX2P50458 406 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 MINOS1Q5TGZ0 78 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 PET117Q6UWS5 81 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 RBKSQ9H477 322 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 S4R3C0 116 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 LINC01619G3V211 115 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 RAMP3O60896 148 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 APCSP02743 223 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SERF2P84101 59 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 SPSB4Q96A44 273 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 PKIBQ9C010 78 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 A0A0B4J2E0 115 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 A0A1B0GX12 115 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 DIRC3C9JPN6 131 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 LYNX1G3V0Z9 82 aa3.48□□□□□ -1.85
CENPF-201ENST00000366955 NBR2O15453 112 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms