RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 OR4A5Q8NH83 315 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 DCUN1D4Q92564 292 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 DPF1Q92782 380 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 MRGPRFQ96AM1 343 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 SLC2A9Q9NRM0 540 aa11.51□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa11.5□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 MARCH11A6NNE9 402 aa11.5□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1-39P01597 117 aa11.5□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1D-39P04432 117 aa11.5□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 AREGP15514 252 aa11.5□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 G6PCP35575 357 aa11.5□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.5□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.5□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.5□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.5□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0G2JLM5 398 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD34BA5PLL1 514 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 FABP12A6NFH5 140 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 SEC14L6B5MCN3 397 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 KRASP01116 189 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV12-3P01733 135 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 REG1AP05451 166 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 OR2B8PP59922 312 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ERVK-16P61578 105 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 RND3P61587 244 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 RHOGP84095 191 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 RABL2BQ9UNT1 228 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 NSG2Q9Y328 171 aa11.49□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 NPIPB5A8MRT5 1133 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 K7EIL1 84 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 OVOL1O14753 267 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 OR2J3O76001 311 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 S100GP29377 79 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PIGPP57054 158 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 REC114Q7Z4M0 266 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TERB2Q8NHR7 220 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 MARCH1Q8TCQ1 289 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 MRAPQ8TCY5 172 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 USMG5Q96IX5 58 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 V9GYH0 126 aa11.48□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 IGLC7A0M8Q6 106 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 DPPA5A6NC42 116 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 CRYGCP07315 174 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 AKAIN1P0CW23 69 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 CTRB1P17538 263 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PSMB6P28072 239 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 MEF2DQ14814 521 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 CTRB2Q6GPI1 263 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A42Q86VD7 318 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 SEC22AQ96IW7 307 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 FANCD2OSQ96PS1 177 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TP53RKQ96S44 253 aa11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 FAM223BA6NKX1 122 aa11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 DBX1A6NMT0 343 aa11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 DISC1C4P0D8 188 aa11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF79Q15937 498 aa11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
CSAG1-201ENST00000361211 TGP01266 2768 aa11.46□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 H0Y980 276 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFB8O95169 186 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 FGF2P09038 288 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 ATP5G2Q06055 141 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 C15orf32Q32M92 178 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC190Q86UF4 302 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 CADM3Q8N126 398 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 NECAP1Q8NC96 275 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 OR51S1Q8NGJ8 323 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM63Q969Q1 353 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 S4R3C0 116 aa11.45□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa11.44□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 C15orf61A6NNL5 157 aa11.44□□□□□ -0.58
CSAG1-201ENST00000361211 BMPR1BO00238 502 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 245.2 ms