RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 ERGP11308 486 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 ZNF250P15622 560 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 P2RY6Q15077 328 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 A0A0G2JMM0 328 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PPB8 328 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PRS3 328 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CELA3BP08861 270 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 RFPL3SP0C7P2 107 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.01□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 H0Y980 276 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 WDFY2Q96P53 400 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CFAP161Q6P656 301 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 NGFRP08138 427 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 EVI2AP22794 236 aa9□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 TSPAN7P41732 249 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 PKIAP61925 76 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 FAM27BQ5VT28 67 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 LEMD1Q68G75 181 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 DDA1Q9BW61 102 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 C5orf67F2Z3F1 127 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CD7P09564 240 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 BCL2P10415 239 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 GALP22466 123 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CTDSPLO15194 276 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CHAC2Q8WUX2 184 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 SEMA5BQ9P283 1151 aa9□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 ARID2Q68CP9 1835 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 TNFRSF9Q07011 255 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 SAP25Q8TEE9 199 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 PARP14Q460N5 1801 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 MED12Q93074 2177 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.99□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 SBF1O95248 1867 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CACNA1EQ15878 2313 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 KCNS1Q96KK3 526 aa8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 PSCAO43653 123 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 TMEM127O75204 238 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CXCL2P19875 107 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 FHITP49789 147 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 LHFPL6Q9Y693 200 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 PRSS23O95084 383 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 PRR31Q5SQ13 230 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 PEX7O00628 323 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.98□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 TRGC1P0CF51 173 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CNTFRP26992 372 aa8.98□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 CENPWQ5EE01 88 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 TMEM219Q86XT9 240 aa8.98□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 SCAND1P57086 179 aa8.98□□□□□ -0.97
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CLN8-201ENST00000331222 SCN4AP35499 1836 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CDS2O95674 445 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 TMEM42Q69YG0 159 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 C14orf144Q96I85 54 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.98□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 SLC17A3O00476 420 aa8.97□□□□□ -0.97
CLN8-201ENST00000331222 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.97□□□□□ -0.97
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