RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 FAM168AQ92567 244 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 LEUTXA8MZ59 168 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 C12orf77C9JDV5 145 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 FOXH1O75593 365 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 ADAP1O75689 374 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 SELENOTP62341 195 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 PPP1R17O96001 155 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 COL8A1P27658 744 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 CA7P43166 264 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 KCNK15Q9H427 330 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 OR4C46A6NHA9 309 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 NPFFO15130 113 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 WDR82Q6UXN9 313 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 VPS25Q9BRG1 176 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 ATG101Q9BSB4 218 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 CACNG7P62955 275 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 ZNF429Q86V71 674 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 MMD2Q8IY49 270 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 TMEM18Q96B42 140 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM218A2RU14 115 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 M0R2Z0 102 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 FCN1O00602 326 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 LIPFP07098 398 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 TCL1AP56279 114 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 LY6DQ14210 128 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 METRNQ9UJH8 293 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPN3-201ENST00000262539 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.9□□□□□ -1.3
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PTPN3-201ENST00000262539 H7C2G1 150 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 DYNLT3P51808 116 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 CD300CQ08708 224 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 VAMP8Q9BV40 100 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 PLAUP00749 431 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 FAM78BQ5VT40 261 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 Q6P435 159 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPN3-201ENST00000262539 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.9□□□□□ -1.31
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