RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 SNAPC3Q92966 411 aa12.13□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 RNF5Q99942 180 aa12.13□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 SOSTQ9BQB4 213 aa12.13□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 MFFQ9GZY8 342 aa12.13□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0B4J203 849 aa12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GVG6 124 aa12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 H7C2Y5 167 aa12.12□□□□□ -0.47
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SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB25P24278 435 aa12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 OXA1LQ15070 435 aa12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 PSG5Q15238 335 aa12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 PLAC9Q5JTB6 97 aa12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 HACD4Q5VWC8 232 aa12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 PECRQ9BY49 303 aa12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 MGAT4AQ9UM21 535 aa12.12□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 CEACAM6P40199 344 aa12.11□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN12P56749 244 aa12.11□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 PLA2G7Q13093 441 aa12.11□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 BAK1Q16611 211 aa12.11□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 MZT2BQ6NZ67 158 aa12.11□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.11□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 FAM3DQ96BQ1 224 aa12.11□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 USMG5Q96IX5 58 aa12.11□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 DIABLOQ9NR28 239 aa12.11□□□□□ -0.47
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SPCS1-201ENST00000233025 FXYD3Q14802 87 aa12.1□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 TM4SF20Q53R12 229 aa12.1□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 PDPNQ86YL7 162 aa12.1□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF645Q8N7E2 425 aa12.1□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 C5orf30Q96GV9 206 aa12.1□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 RHBDL2Q9NX52 303 aa12.1□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 RDH8Q9NYR8 311 aa12.1□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 KCNK7Q9Y2U2 307 aa12.1□□□□□ -0.47
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SPCS1-201ENST00000233025 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa12.09□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa12.09□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 IGLL5B9A064 214 aa12.09□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 PFDN1O60925 122 aa12.09□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV2-23P01705 113 aa12.09□□□□□ -0.47
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM177Q53S58 311 aa12.09□□□□□ -0.47
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SPCS1-201ENST00000233025 KIR2DL5AQ8N109 375 aa12.09□□□□□ -0.47
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SPCS1-201ENST00000233025 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa12.08□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 CENPXA8MT69 81 aa12.08□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 TRDCB7Z8K6 153 aa12.08□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 M0R1X1 148 aa12.08□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 CTDSPLO15194 276 aa12.08□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 HLA-DQB1P01920 261 aa12.08□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 APOA2P02652 100 aa12.08□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 CRYGBP07316 175 aa12.08□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 CD3GP09693 182 aa12.08□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 RPS16P62249 146 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf76Q3KRA6 126 aa12.08□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
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SPCS1-201ENST00000233025 STPG3Q8N7X2 389 aa12.07□□□□□ -0.48
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SPCS1-201ENST00000233025 ENKURQ8TC29 256 aa12.07□□□□□ -0.48
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SPCS1-201ENST00000233025 MLXQ9UH92 298 aa12.07□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D24Q9ULP9 559 aa12.07□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 AGRNO00468 2067 aa12.07□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0A6YYH2 397 aa12.06□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 A6NJ64 397 aa12.06□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 MFNGO00587 321 aa12.06□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
SPCS1-201ENST00000233025 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
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