RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 FIS1Q9Y3D6 152 aa-1.2□□□□□ -2.6
SHQ1-204ENST00000468347 PLCE1Q9P212 2302 aa-1.2□□□□□ -2.6
SHQ1-204ENST00000468347 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
SHQ1-204ENST00000468347 TAF1LQ8IZX4 1826 aa-1.2□□□□□ -2.6
SHQ1-204ENST00000468347 SOGA1O94964 1423 aa-1.21□□□□□ -2.6
SHQ1-204ENST00000468347 HECW1Q76N89 1606 aa-1.21□□□□□ -2.6
SHQ1-204ENST00000468347 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-1.21□□□□□ -2.6
SHQ1-204ENST00000468347 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
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SHQ1-204ENST00000468347 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa-1.22□□□□□ -2.6
SHQ1-204ENST00000468347 Q8IZM0 81 aa-1.22□□□□□ -2.6
SHQ1-204ENST00000468347 Q8N402 240 aa-1.22□□□□□ -2.6
SHQ1-204ENST00000468347 HDDC3Q8N4P3 179 aa-1.22□□□□□ -2.6
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