RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CXCL13O43927 109 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RND2P52198 227 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FOXF1Q12946 379 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FBXW9Q5XUX1 488 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 WFDC8Q8IUA0 241 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RELTQ969Z4 430 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 TMEM229AB2RXF0 380 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 Q0VG73 95 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 F8W1H4 67 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 Q56UQ5 140 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 GAPTQ8N292 157 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DOK4Q8TEW6 326 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RNF167Q9H6Y7 350 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 KLK13Q9UKR3 277 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A0G2JLM5 398 aa4.21□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 J3QRE1 110 aa4.21□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM10L1P0DMW3 83 aa4.21□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 LHX2P50458 406 aa4.21□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 ADIPOQQ15848 244 aa4.21□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.21□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.21□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 SMIM10Q96HG1 83 aa4.21□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PQF6 199 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 TCF21O43680 179 aa4.21□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 ACTL10Q5JWF8 245 aa4.21□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 PATE1Q8WXA2 126 aa4.21□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 HARBI1Q96MB7 349 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM126AQ9H061 195 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 PAGE4O60829 102 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 FCGR3BO75015 233 aa4.2□□□□□ -1.74
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