RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 NDUFS7O75251 213 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 PPYP01298 95 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF728P0DKX0 622 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 IGFBP2P18065 325 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 OMGP23515 440 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 KIR2DS4P43632 304 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 RAB11AP62491 216 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 TMEM187Q14656 261 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 GNMTQ14749 295 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 KIR2DS1Q14954 304 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 FAM222BQ8WU58 562 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 TMEM18Q96B42 140 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 PPIAL4DF5H284 164 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 HSPA12AO43301 675 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 HBE1P02100 147 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 PIGPP57054 158 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 HERV-K104P61576 105 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 PMS2P11Q13670 270 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 OR52L2PQ8NGH6 319 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 PPIAL4AQ9Y536 164 aa9.6□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 TNFSF12O43508 249 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 PITX3O75364 302 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 FCN3O75636 299 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 PDLIM4P50479 330 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 COTL1Q14019 142 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 BTNL3Q6UXE8 466 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 GAPTQ8N292 157 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 OR2C3Q8N628 320 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 ACY3Q96HD9 319 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 NAA60Q9H7X0 242 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 VPS13CQ709C8 3753 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 HBZP02008 142 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 TLE4Q04727 773 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 UTF1Q5T230 341 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 TEX36Q5VZQ5 186 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 Q6ZS49 121 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 C18orf12Q96KH6 178 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CDCA8-201ENST00000327331 CENPEQ02224 2701 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 ODAMA1E959 279 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 IGSF23A1L1A6 192 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 SCGB1D1O95968 90 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 LRTM2Q8N967 370 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 MOB3AQ96BX8 217 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF665Q9H7R5 613 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 CCL28Q9NRJ3 127 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 RNF150Q9ULK6 438 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 TENM4Q6N022 2769 aa9.58□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 PPP5D1E7EU14 171 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 MGST3O14880 152 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 ADAM20O43506 726 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 CMTM1Q8IZ96 169 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 SDSLQ96GA7 329 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 FKBP11Q9NYL4 201 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 GNG13Q9P2W3 67 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 CTSZQ9UBR2 303 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 MMP9P14780 707 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 GNRHRP30968 328 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 PPOXP50336 477 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.881e-6■□□□□ 9.9
CDCA8-201ENST00000327331 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 LEAP2Q969E1 77 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.57□□□□□ -0.88
CDCA8-201ENST00000327331 LPAR2Q9HBW0 351 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.3 ms