RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-216	ENST00000588477	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.34	□□□□□ -0.59
IFT20-216	ENST00000588477	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		11.34	□□□□□ -0.59
IFT20-216	ENST00000588477	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		11.34	□□□□□ -0.59
IFT20-216	ENST00000588477	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		11.34	□□□□□ -0.59
IFT20-216	ENST00000588477	RNF183	Q96D59	192 aa		11.34	□□□□□ -0.59
IFT20-216	ENST00000588477	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		11.34	□□□□□ -0.59
IFT20-216	ENST00000588477	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.34	□□□□□ -0.59
IFT20-216	ENST00000588477	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		11.34	□□□□□ -0.59
IFT20-216	ENST00000588477	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
IFT20-216	ENST00000588477	LINC00473	A8K010	186 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	UBE2C	O00762	179 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	WNT4	P56705	351 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PRR20E	P86478	221 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PRR20C	P86479	221 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PRR20D	P86480	221 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PRR20B	P86481	221 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PRR20A	P86496	221 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	CDK10	Q15131	360 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	OR4A47	Q6IF82	309 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MMD2	Q8IY49	270 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	OR2C3	Q8N628	320 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	STPG3	Q8N7X2	389 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PHYHIP	Q92561	330 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		11.33	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MYL12B	O14950	172 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FABP7	O15540	132 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	P2RY14	Q15391	338 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF585B	Q52M93	769 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		11.31	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	DPPA5	A6NC42	116 aa		11.31	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	CD37	P11049	281 aa		11.31	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		11.31	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		11.31	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		11.31	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	TEX22	C9J3V5	150 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477		E7EUB6	86 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	C8orf88	P0DMB2	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	SETD9	Q8NE22	299 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FCGR3B	O75015	233 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	CLEC3B	P05452	202 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MARC2	Q969Z3	335 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	GINS4	Q9BRT9	223 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.29	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	SLC17A2	O00624	439 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FCGR3A	P08637	254 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	CTRB1	P17538	263 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	AHSA2	Q719I0	299 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	GFI1	Q99684	422 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FBXL17	Q9UF56	701 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		11.28	□□□□□ -0.6
IFT20-216	ENST00000588477	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
IFT20-216	ENST00000588477		A0A1B0GW64	132 aa		11.27	□□□□□ -0.61
IFT20-216	ENST00000588477	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.27	□□□□□ -0.61
IFT20-216	ENST00000588477		J3QRK9	145 aa		11.27	□□□□□ -0.61
IFT20-216	ENST00000588477	DHFR	P00374	187 aa		11.27	□□□□□ -0.61
IFT20-216	ENST00000588477	IFNA4	P05014	189 aa		11.27	□□□□□ -0.61

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