RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566689.5

BBS2-217, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 4

Gene BBS2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-217	ENST00000566689	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	DYRK2	Q92630	601 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	GALM	Q96C23	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689		Q9N2K0	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ABCA1	O95477	2261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689		A0A1W2PPR1	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	NDUFB3	O43676	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	NXPH3	O95157	252 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	NAPSA	O96009	420 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	GYPA	P02724	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ANXA3	P12429	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	AKR1C4	P17516	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZBTB25	P24278	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	FCGR2C	P31995	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	FXYD4	P59646	89 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	LCN2	P80188	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	AES	Q08117	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689		Q6ZS49	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	RNF183	Q96D59	192 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	PHB2	Q99623	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	CCL19	Q99731	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689		K7N7A8	449 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	VCY	O14598	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	OR2J3	O76001	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	RGS11	O94810	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SCT	P09683	121 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	NDUFB7	P17568	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	SRD5A1	P18405	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	CD34	P28906	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-217	ENST00000566689	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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