RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	TENM4	Q6N022	2769 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SSSCA1	O60232	199 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	PPY	P01298	95 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	IGFBP2	P18065	325 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SERF2	P84101	59 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	COL10A1	Q03692	680 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	BTF3L4	Q96K17	158 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF488	Q96MN9	340 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	GNG13	Q9P2W3	67 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF205	O95201	554 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	TYMS	P04818	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	AADAC	P22760	399 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF154	Q13106	437 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	LINC00596	Q86U02	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	PRSS47	A8MTI9	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	RHBDL1	O75783	438 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	NAPSA	O96009	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	OMG	P23515	440 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	RAB40C	Q96S21	281 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997		Q9N2K0	584 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	RFNG	Q9Y644	331 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM210	A6NLX4	147 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997		J3QT63	122 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SELENOV	P59797	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SPRN	Q5BIV9	151 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	LRP5L	A4QPB2	252 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	GRP	P07492	148 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	GNRHR	P30968	328 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	OR5B12	Q96R08	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM250	H0YL14	139 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	CDIPT	O14735	213 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	EREG	O14944	169 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ADAM20	O43506	726 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SPRY3	O43610	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	CST7	O76096	145 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	WNT2	P09544	360 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	RUNX1	Q01196	453 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	PAX5	Q02548	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	IMMP2L	Q96T52	175 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	HSPB6	O14558	160 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	CHST1	O43916	411 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM50A	O95807	157 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	PAX9	P55771	341 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	RPRM	Q9NS64	109 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997	DYSF	O75923	2080 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-208	ENST00000546997		A0A1W2PPR1	153 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	KBTBD11	O94819	623 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	LINC00614	P0C842	121 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	OR2V2	Q96R30	315 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	TACC2	O95359	2948 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997		H0Y980	276 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-208	ENST00000546997	HS3ST1	O14792	307 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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