RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421051.1

AP000289.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP000289.1, Length 1,361 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000289.1-201ENST00000421051 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 POC1BQ8TC44 478 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM234Q8WY98 164 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 SPSB1Q96BD6 273 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 RAB40CQ96S21 281 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 TP53RKQ96S44 253 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 WWTR1Q9GZV5 400 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 OR51I2Q9H344 312 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 RPRMQ9NS64 109 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.01□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 VWC2LB2RUY7 222 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 MLNRO43193 412 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 SOX15O60248 233 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 DHRS3O75911 302 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 CD55P08174 381 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 VDAC1P21796 283 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 AADACP22760 399 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 RUNX1Q01196 453 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 HIST3H3Q16695 136 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM183BQ1AE95 376 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 AARDQ4LEZ3 155 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 PRR22Q8IZ63 422 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM123Q8N131 208 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 OR5L1Q8NGL2 311 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 OR5D13Q8NGL4 314 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 REEP6Q96HR9 211 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 LYZL4Q96KX0 146 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 MS4A10Q96PG2 267 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 SMIM7Q9BQ49 75 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 LRP5LA4QPB2 252 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 SSSCA1O60232 199 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 PPBPP02775 128 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 SELEP16581 610 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 EFNA4P52798 201 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 HERV-K104P61576 105 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 GNB2P62879 340 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 FOXL1Q12952 345 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 RNF138Q8WVD3 245 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 TOMM40LQ969M1 308 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 TBX15Q96SF7 602 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 ADOQ96SZ5 270 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 MANBALQ9NQG1 85 aa7.99□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 LIPT2A6NK58 231 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 SHISA9B4DS77 424 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 H0Y980 276 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 SCGB1D1O95968 90 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 IL12BP29460 328 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 RAB7AP51149 207 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 ERVS71-1P61550 626 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 ADIRFQ15847 76 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 LEMD1Q68G75 181 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 MAGT1Q9H0U3 335 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
AP000289.1-201ENST00000421051 MED29Q9NX70 200 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms