RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384376.1

RNU6-434P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 434, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-434P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-434P-201ENST00000384376 NOTCH1P46531 2555 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 SMARCA4P51532 1647 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 POLEQ07864 2286 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 TRAV7A0A075B6U4 112 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 MEIKINA0A087WXM9 373 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 A0A0D9SEW6 157 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 TMEM213A2RRL7 107 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 F8W036 122 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 HLA-DQB2P05538 268 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 CCL5P13501 91 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 FXYD7P58549 80 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 TAS2R20P59543 309 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 HLA-DRB3P79483 266 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 Q1T7F1 81 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 DNAL1Q4LDG9 190 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 SLC7A6Q92536 515 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 LRRC45Q96CN5 670 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 SLC22A4Q9H015 551 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 MS4A6AQ9H2W1 248 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 CST9LQ9H4G1 147 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 TECTAO75443 2155 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 FLT4P35916 1363 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 GLI3P10071 1580 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 STRCQ7RTU9 1775 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 A0A0J9YW62 118 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 TRPC5OSA6NMA1 111 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 H3BT86 120 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 H7C2G1 150 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 IL6P05231 212 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 PSMB8P28062 276 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 ALDH3A1P30838 453 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 CD79BP40259 229 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 RPL28P46779 137 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 RAB14P61106 215 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 CDK5R1Q15078 307 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 EBPQ15125 230 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 ANGPT1Q15389 498 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 PLPPR5Q32ZL2 321 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 Q8N2B8 174 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 C9orf163Q8N9P6 203 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 RAB2BQ8WUD1 216 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 MBD3L1Q8WWY6 194 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 ASB13Q8WXK3 278 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 TIPINQ9BVW5 301 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 EURLQ9NYK6 297 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 TIMM9Q9Y5J7 89 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-434P-201ENST00000384376 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 C5orf49A4QMS7 147 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 TRAPPC13A5PLN9 417 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 STX10O60499 249 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 RPSAP08865 295 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 EMP1P54849 157 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 PLCXD2Q0VAA5 305 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 ACSM3Q53FZ2 586 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 FAM173BQ6P4H8 233 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 DNM1P34Q6PK57 102 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 SPATA24Q86W54 205 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 SYCE1Q8N0S2 351 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 CCL13Q99616 98 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 MED9Q9NWA0 146 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 NUP160Q12769 1436 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 CACNA1BQ00975 2339 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 OR51F1A6NGY5 319 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 HSBP1L1C9JCN9 74 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 TRAPPC2LH3BP13 241 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 COX7A2LO14548 114 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 APOMO95445 188 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 PPBPP02775 128 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 TFPTP0C1Z6 253 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 CXCR4P61073 352 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 AP1S1P61966 158 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 CD302Q8IX05 232 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 DYNAPQ8N1N2 210 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 BBS2Q9BXC9 721 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 DERL2Q9GZP9 239 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 WDR54Q9H977 334 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 HRASLSQ9HDD0 168 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-434P-201ENST00000384376 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms