RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM217Q8N7C4 229 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR5B3Q8NH48 314 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL17Q9UF56 701 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PRNDQ9UKY0 176 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR5H14A6NHG9 310 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HMX3A6NHT5 357 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SNRPGP15A8MWD9 76 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 H3BP45 60 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR2A4O95047 310 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MYOD1P15172 320 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CD34P28906 385 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF585BQ52M93 769 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2NLQ5JXB2 153 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 COMMD1Q8N668 190 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FAM216AQ8WUB2 273 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RAX2Q96IS3 184 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DMRTB1Q96MA1 342 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR2A7Q96R45 310 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MED28Q9H204 178 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CA2P00918 260 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HKR1P10072 659 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 NPPCP23582 126 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R31P59538 309 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 BAXQ07812 192 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OXLD1Q5BKU9 147 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD4AQ8N468 514 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC18CQ8NCF0 446 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 Q8TCH9 128 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF14Q92956 283 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DOK5Q9P104 306 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FLNCQ14315 2725 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 FSTP19883 344 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 AADACP22760 399 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ANOS1P23352 680 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CX3CL1P78423 397 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 DGCR2P98153 550 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 STHQ8IWL8 128 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 STOML3Q8TAV4 291 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 TBX15Q96SF7 602 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SLA2Q9H6Q3 261 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT15Q9NV35 164 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 LAMA5O15230 3695 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR4C46A6NHA9 309 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 F8VVB4 439 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 F8VWA3 439 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 G3V318 75 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR2C1O95371 312 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 G6PCP35575 357 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GAMTQ14353 236 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GAPTQ8N292 157 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GPHA2Q96T91 129 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 Q9N2K0 584 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 V9GYS6 101 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CYSRT1A8MQ03 144 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 IGLL1P15814 213 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CCL1P22362 96 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK11-1P61568 191 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RGS21Q2M5E4 152 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 HYLS1Q96M11 299 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 OR51J1Q9H342 316 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-201ENST00000348564 RHOFQ9HBH0 211 aa3.61□□□□□ -1.83
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