RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 SDHAF2Q9NX18 166 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-227ENST00000551441 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-227ENST00000551441 S4R3C0 116 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-227ENST00000551441 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 A0A0J9YWU9 116 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 C2orf70A6NJV1 201 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 BET1O15155 118 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 AIREO43918 545 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 DEDDO75618 318 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 OR2J3O76001 311 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 TAS2R43P59537 309 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 C10orf55Q5SWW7 151 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 DDB2Q92466 427 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 S100A14Q9HCY8 104 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 EFCAB10A6NFE3 127 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 MYL12BO14950 172 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 KIR2DS2P43631 304 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 TMEM50BP56557 158 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 TMEM177Q53S58 311 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 IGSF11Q5DX21 431 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 AHSA2Q719I0 299 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 LAX1Q8IWV1 398 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 PQLC1Q8N2U9 271 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 MAFIPQ8WZ33 124 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 PECRQ9BY49 303 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 TRDCB7Z8K6 153 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 J3QRK9 145 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 TUSC2O75896 110 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 WNT4P56705 351 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 PRSS8Q16651 343 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 GGTLC1Q9BX51 225 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 DMRT1Q9Y5R6 373 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 HMX3A6NHT5 357 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 CRYZL1O95825 349 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 GSTT2P0CG29 244 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 GSTT2BP0CG30 244 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 SRMP19623 302 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 CLDN12P56749 244 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 CBX3Q13185 183 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 C15orf32Q32M92 178 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 VMA21Q3ZAQ7 101 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 LAIR2Q6ISS4 152 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 CEACAM19Q7Z692 300 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 TMEM61Q8N0U2 210 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 OR52B4Q8NGK2 314 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 THRSPQ92748 146 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 GFI1Q99684 422 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 C12orf4Q9NQ89 552 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 ZNF320A2RRD8 509 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 FAM223BA6NKX1 122 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 BPNT1O95861 308 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 CD1AP06126 327 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 PLA2G7Q13093 441 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 RTL8BQ17RB0 113 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 HSD17B12Q53GQ0 312 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 PLAC9Q5JTB6 97 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 SLC16A13Q7RTY0 426 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 FAM223AQ8IWN6 122 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 NANOGP1Q8N7R0 232 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 PLGRKTQ9HBL7 147 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 MLXQ9UH92 298 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 MGAT4AQ9UM21 535 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 PCLOQ9Y6V0 5065 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 NUPR2A6NF83 97 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 LINC00473A8K010 186 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 LCE2BO14633 110 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 FABP7O15540 132 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 CBLN1P23435 193 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 UBE2KP61086 200 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 LYG2Q86SG7 212 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 FAM89BQ8N5H3 189 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 TEX45Q8NA69 505 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 OR6M1Q8NGM8 313 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 FBXL7Q9UJT9 491 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 VPS13DQ5THJ4 4388 aa12.02□□□□□ -0.48
CS-227ENST00000551441 GGCTO75223 188 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
CS-227ENST00000551441 TM4SF20Q53R12 229 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-227ENST00000551441 OR2B11Q5JQS5 317 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-227ENST00000551441 BTNL8Q6UX41 500 aa12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms