RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 CYB5BO43169 146 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 FGF16O43320 207 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CDKN1AP38936 164 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 SP6Q3SY56 376 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 RARRES2Q99969 163 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 NDUFB3O43676 98 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 FSTL3O95633 263 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 SLC25A4P12235 298 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 SSTP61278 116 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 NAA60Q9H7X0 242 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CALYQ9NYX4 217 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 FBXL17Q9UF56 701 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 K7EPK0 472 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 HSD17B6O14756 317 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TCAPO15273 167 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 FCN3O75636 299 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 HLA-GP17693 338 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 HTD2P86397 168 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TLE4Q04727 773 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 GNMTQ14749 295 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 RAB9BQ9NP90 201 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CTSZQ9UBR2 303 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CENPEQ02224 2701 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 hADV38S2A0JD32 116 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TRGC2P03986 189 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 LTC4SQ16873 150 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TIMD4Q96H15 378 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.18□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TACC2O95359 2948 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.17□□□□□ -1.26
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THBS3-210ENST00000541576 CGB3P0DN86 165 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CGB7P0DN87 165 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 S100GP29377 79 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 RND3P61587 244 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TCF23Q7RTU1 214 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 RAB1CQ92928 201 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 GALNT14Q96FL9 552 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CHODLQ9H9P2 273 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 GNG12Q9UBI6 72 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CLN8Q9UBY8 286 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 KPTNQ9Y664 436 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 IFITM10A6NMD0 228 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 F2RL2O00254 374 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 PPP1R2P9O14990 202 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 MPPED1O15442 326 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 IGLV2-14P01704 120 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 OR5AC1P0C628 307 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 DDTP30046 118 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TMEM33P57088 247 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 BATFQ16520 125 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 CORO2AQ92828 525 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 JPT1Q9UK76 154 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 KCNS2Q9ULS6 477 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.17□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 A1L4Q6 167 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TSTD3H0UI37 97 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TMEM187Q14656 261 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.16□□□□□ -1.26
THBS3-210ENST00000541576 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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