RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 BCL3P20749 454 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 NPBWR2P48146 333 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 AP3S2P59780 193 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 PRR20EP86478 221 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 PRR20CP86479 221 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 PRR20DP86480 221 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 PRR20BP86481 221 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 PRR20AP86496 221 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 ZNF146Q15072 292 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 PIGYQ3MUY2 71 aa5.48□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 SLAMF9Q96A28 289 aa5.48□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 Q96M66 194 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 PECRQ9BY49 303 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 MCUBQ9NWR8 336 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 IL36GQ9NZH8 169 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 PSG11Q9UQ72 335 aa5.48□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.47□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 CXorf65A6NEN9 183 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 M0QYG6 137 aa5.47□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 IGHV3-7P01780 117 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 CD3DP04234 171 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF735P0CB33 412 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 AKAIN1P0CW23 69 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 HLA-DMAP28067 261 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 DUSP1P28562 367 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 RCVRNP35243 200 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 F2RL1P55085 397 aa5.47□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 TAS2R19P59542 299 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 GNG2P59768 71 aa5.47□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF554Q86TJ5 538 aa5.47□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 LEAP2Q969E1 77 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 LINC00574Q9H8X3 128 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 NUDT15Q9NV35 164 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 ANAPC10Q9UM13 185 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.47□□□□□ -1.53
CASQ1-203ENST00000481081 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.47□□□□□ -1.53
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CASQ1-203ENST00000481081 HMX3A6NHT5 357 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 HSD17B6O14756 317 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 SOX15O60248 233 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 RGS11O94810 467 aa5.46□□□□□ -1.54
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CASQ1-203ENST00000481081 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.46□□□□□ -1.54
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CASQ1-203ENST00000481081 CD1BP29016 333 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 ARFRP1Q13795 201 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.46□□□□□ -1.54
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CASQ1-203ENST00000481081 MOB3BQ86TA1 216 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR8H1Q8NGG4 311 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OR51S1Q8NGJ8 323 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 SNAPC3Q92966 411 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 SULT4A1Q9BR01 284 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.46□□□□□ -1.54
CASQ1-203ENST00000481081 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
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