RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 IMMP2LQ96T52 175 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 FUT9Q9Y231 359 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 C17orf98A8MV24 154 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 PRRG2O14669 202 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 PAFAH1B2P68402 229 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 COX7A2P2O60397 106 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 RND2P52198 227 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 BORCS7Q96B45 105 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CALYQ9NYX4 217 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 A0A087X0M5 115 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GX30 115 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 LNP1A1A4G5 178 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 FAM157AC9JC47 383 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 YPEL1O60688 119 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CT45A6P0DMU7 189 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CT45A5P0DMU8 189 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CT45A7P0DMV0 189 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TNFSF10P50591 281 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 PAX9P55771 341 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 FAM209BQ5JX69 171 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TMEM68Q96MH6 324 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 YPEL2Q96QA6 119 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TMEM140Q9NV12 185 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 NDUFB3O43676 98 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 G0S2P27469 103 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 UBE2G1P62253 170 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 OR5R1Q8NH85 324 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 MS4A10Q96PG2 267 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2BKO60814 126 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 IGHV2-5P01817 119 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2BJP06899 126 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2BOP23527 126 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 OR10J1P30954 320 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2BBP33778 126 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2BDP58876 126 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2BCP62807 126 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 LMO1P25800 156 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC13O75165 2243 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 MT-ND6P03923 174 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CELA3BP08861 270 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 HNF1AP20823 631 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ERVK11-1P61568 191 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 WDR82Q6UXN9 313 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 IL19Q9UHD0 177 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TCF19Q9Y242 345 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 R4GN57 208 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JRQ6 117 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 NDUFB4O95168 129 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CXCL1P09341 107 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CECR9P0C854 216 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TFF3Q07654 80 aa7.42□□□□□ -1.22
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