RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 IGLC3P0DOY3 106 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CRISP2P16562 243 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 C11orf42Q8N5U0 333 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 PSMF1Q92530 271 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.3□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ODAMA1E959 279 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 RAB29O14966 203 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR2M7Q8NG81 312 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 WDR54Q9H977 334 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 PRSS46E5RG02 174 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 STAG3L2P0CL84 134 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 STAG3L3P0CL85 134 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CD33P20138 364 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 AAED1Q7RTV5 226 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 STPG4Q8N801 248 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR6C1Q96RD1 312 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 C15orf62A8K5M9 175 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 F2Z2F3 143 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 G3V3Y1 287 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 HSPB6O14558 160 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 MPDU1O75352 247 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 HYPMO75409 117 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 AREGP15514 252 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CBLN1P23435 193 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OPRK1P41145 380 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TMPRSS3P57727 454 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TLE1Q04724 770 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 WDR31Q8NA23 367 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 KCNS1Q96KK3 526 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.29□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OR5B21A6NL26 309 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CDIPTO14735 213 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CCL25O15444 150 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TCF21O43680 179 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SCRG1O75711 98 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CRYAAP02489 173 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 KITLGP21583 273 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SRD5A2P31213 254 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 GNG10P50151 68 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 OCC1Q8TAD7 63 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CLN8Q9UBY8 286 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 V9GYV3 84 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 CLDN14O95500 239 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ERVK11-1P61568 191 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 LRP11Q86VZ4 500 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 SLC25A45Q8N413 288 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 COX6A1P12074 109 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 EGR1P18146 543 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 TFPI2P48307 235 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.28□□□□□ -1.08
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HCG18-242ENST00000602319 RLN3Q8WXF3 142 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 HES4Q9HCC6 221 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.28□□□□□ -1.08
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PR80 420 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 ZG16O60844 167 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 RAMP3O60896 148 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 MT-ND6P03923 174 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 PTTG1IPP53801 180 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 PMP22Q01453 160 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 COX19Q49B96 90 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 SPATA45Q537H7 98 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 LEMD1Q68G75 181 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
HCG18-242ENST00000602319 GNB4Q9HAV0 340 aa8.27□□□□□ -1.09
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