RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM46BQ96A09 425 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF5Q99942 180 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 COA4Q9NYJ1 87 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 JPT1Q9UK76 154 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 ING4Q9UNL4 249 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.58□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 NACAE9PAV3 2078 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1W2PP11 408 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM90A7PA6NKC0 464 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 A8MWP6 167 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 H7C2Y5 167 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 YPEL1O60688 119 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 PROP1O75360 226 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 CDRT1O95170 752 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 SPDEFO95238 335 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 CRYGBP07316 175 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 P0DMU3 169 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM231AP0DMU4 169 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM231CP0DMU5 169 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 LGALS7P47929 136 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 RHOGP84095 191 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF85Q03923 595 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 GK3PQ14409 553 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 RSU1Q15404 277 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 C6orf183Q5T699 404 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 Q6ZRM9 215 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 Q6ZTC4 211 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 GPHB5Q86YW7 130 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 OR51A2Q8NGJ7 313 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 OR52N1Q8NH53 320 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 NEK7Q8TDX7 302 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM68Q96MH6 324 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 YPEL2Q96QA6 119 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF126Q9BV68 326 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 SCRT1Q9BWW7 348 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 MAGIXQ9H6Y5 334 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 GNG8Q9UK08 70 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 AGRNO00468 2067 aa5.57□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 EPM2AB3EWF7 344 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 IGLV2-23P01705 113 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 AMBPP02760 352 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2T7P0C7T2 308 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 C8orf88P0DMB2 117 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 PRKACGP22612 351 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 HLA-DMBP28068 263 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 EPHA2P29317 976 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 MC5RP33032 325 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 CRISP1P54107 249 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 HTD2P86397 168 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 ATP5G2Q06055 141 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 MPV17LQ2QL34 196 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF529Q6P280 563 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 Q8NAQ8 132 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 OR5B3Q8NH48 314 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 THRSPQ92748 146 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 GALNT14Q96FL9 552 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 ATP6V0BQ99437 205 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 SPXQ9BT56 116 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 ALG8Q9BVK2 526 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 HRH4Q9H3N8 390 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 RAB9BQ9NP90 201 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 IL36GQ9NZH8 169 aa5.56□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM223BA6NKX1 122 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 SC5DO75845 299 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 MAS1P04201 325 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 CD74P04233 296 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 OR9G9P0C7N8 305 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 SERPINA2P20848 420 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 MLANAQ16655 118 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 TRAT1Q6PIZ9 186 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 LINC00596Q86U02 117 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 STX19Q8N4C7 294 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF383Q8NA42 475 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2AK2Q8NG84 335 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 OR10H4Q8NGA5 316 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM163Q8TC26 289 aa5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SMARCE1-217ENST00000580654 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.55□□□□□ -1.52
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