RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568445.1

CENPN-208, Transcript of centromere protein N, humanhuman

TSL 5

Gene CENPN, Length 591 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPN-208ENST00000568445 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 MPTX1A8MV57 137 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 F8VVB4 439 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 F8VWA3 439 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 P2RY10O00398 339 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 PGA4P0DJD7 388 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 PGA3P0DJD8 388 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 VPREB1P12018 145 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 HLA-DOBP13765 273 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 KIR2DS4P43632 304 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 ZNF84P51523 738 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 BIDP55957 195 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 C10orf128Q5T292 105 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 CARD17Q5XLA6 110 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 DRAM2Q6UX65 266 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 HOGA1Q86XE5 327 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 ZNF101Q8IZC7 436 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 CHST4Q8NCG5 386 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR13C8Q8NGS7 320 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR8S1Q8NH09 359 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR4K15Q8NH41 348 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 SPTSSAQ969W0 71 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 MARC2Q969Z3 335 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 SPSB1Q96BD6 273 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 C5orf30Q96GV9 206 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 HARBI1Q96MB7 349 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 TM2D1Q9BX74 207 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 EGLN1Q9GZT9 426 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 CHST6Q9GZX3 395 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 SIRPDQ9H106 197 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 ZNRD1Q9P1U0 126 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 MBD2Q9UBB5 411 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 KMT2AQ03164 3969 aa5.13□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 TMEM235A6NFC5 223 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR2AT4A6NND4 320 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 TMEM178BH3BS89 294 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 SPRY2O43597 315 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 DHRS3O75911 302 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 KDM4BO94953 1096 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 SFT2D2O95562 160 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 IGLV3-1P01715 115 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 RLN2P04090 185 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 MSR1P21757 451 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 PRKACBP22694 351 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 WNT5AP41221 380 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 HIST1H3AP68431 136 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 BLOC1S1P78537 153 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 GAMTQ14353 236 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 MELKQ14680 651 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 HMGN3Q15651 99 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 LY6G6FQ5SQ64 297 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 FAAP20Q6NZ36 180 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 PRSS54Q6PEW0 395 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 Q6ZR03 302 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 HIST2H3AQ71DI3 136 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 BAP18Q8IXM2 172 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 SVBPQ8N300 66 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 COMMD1Q8N668 190 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR4F17Q8NGA8 305 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR1J2Q8NGS2 313 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR10K1Q8NGX5 313 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR1S1Q8NH92 325 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 LHX4Q969G2 390 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 OR4F4Q96R69 305 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 GPER1Q99527 375 aa5.12□□□□□ -1.59
CENPN-208ENST00000568445 ASCL2Q99929 193 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms