RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 LURAP1Q96LR2 239 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OXGR1Q96P68 337 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SPACA5Q96QH8 159 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CLCC1Q96S66 551 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 BANF2Q9H503 90 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 C19orf12Q9NSK7 152 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 MPDZO75970 2070 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 A0A087WWC5 75 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 A0A087WZY1 265 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PPE3 182 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 UMAD1C9J7I0 102 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RER1O15258 196 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 GMFGO60234 142 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CLN5O75503 358 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CDS2O95674 445 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 WNT2P09544 360 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SLC2A1P11166 492 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CD59P13987 128 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 FOLR1P15328 257 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CRYGSP22914 178 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 S100PP25815 95 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CSNK1A1P48729 337 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SULT1A1P50225 295 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 FBXW4P57775 412 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 IL11RAQ14626 422 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 UBE2V2Q15819 145 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 HIKESHIQ53FT3 197 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZS49 121 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SLC16A13Q7RTY0 426 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RABEPKQ7Z6M1 372 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TMEM123Q8N131 208 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZFP82Q8N141 532 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 LGI3Q8N145 548 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TMEM156Q8N614 296 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 Q8NFD4 153 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OR51T1Q8NGJ9 327 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 NANPQ8TBE9 248 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SLC22A8Q8TCC7 542 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 MUCL1Q96DR8 90 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 GPER1Q99527 375 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 EMC6Q9BV81 110 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RGCCQ9H4X1 137 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 WFDC1Q9HC57 220 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 DKKL1Q9UK85 242 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 EXPH5Q8NEV8 1989 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 MYO7AQ13402 2215 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PPE2 198 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PR64 198 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PRV1 198 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 C5orf63A6NC05 138 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 OR6C6A6NF89 314 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ZNF732B4DXR9 585 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 M0R135 149 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 WRBO00258 174 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 AGPAT2O15120 278 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 YKT6O15498 198 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 ST8SIA3O43173 380 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 TGOLN2O43493 480 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 NME2P1O60361 137 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 RAMP1O60894 148 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 PDCD6O75340 191 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-211ENST00000522045 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms