RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 C10orf128Q5T292 105 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MED12LQ86YW9 2145 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR2V2Q96R30 315 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ODAMA1E959 279 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PLPP3O14495 311 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TSPAN13O95857 204 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 GP1BBP13224 206 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MMP9P14780 707 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 GATA3P23771 443 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MYBPHQ13203 477 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 IGFBP7Q16270 282 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OTOSQ8NHW6 89 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 UHRF2Q96PU4 802 aa6.49□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ZNF732B4DXR9 585 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PRRG2O14669 202 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 CLDN14O95500 239 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 VSIG8P0DPA2 414 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MPV17LQ2QL34 196 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 P2RX4Q99571 388 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 RELNP78509 3460 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 FREM3P0C091 2139 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SCGB1A1P11684 91 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 GALR1P47211 349 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PLGLB1Q02325 96 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MEP1BQ16820 701 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ASB10Q8WXI3 467 aa6.48□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 XRCC2O43543 280 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 HYPMO75409 117 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 HRASP01112 189 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 UCP1P25874 307 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SFRP2Q96HF1 295 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR5B12Q96R08 314 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 LILRA1O75019 489 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PITX3O75364 302 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 BMP5P22003 454 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 GNRHRP30968 328 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SFTPDP35247 375 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ECI1P42126 302 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MTCP1P56278 107 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PAFAH1B2P68402 229 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PAX2Q02962 417 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ROM1Q03395 351 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 DYRK2Q92630 601 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 IL22RA2Q969J5 263 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 AGMATQ9BSE5 352 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 EHFQ9NZC4 300 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 NAT8Q9UHE5 227 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 KNTC1P50748 2209 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TAX1BP3O14907 124 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 IGLV1-44P01699 117 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 BCL2P10415 239 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TAS2R46P59540 309 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 HERV-K104P63124 156 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 Q6ZT83 130 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OXGR1Q96P68 337 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 HHLA2Q9UM44 414 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.47□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 SLC22A20A6NK97 555 aa6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ISG15P05161 165 aa6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 DBHP09172 617 aa6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 IGLC2P0DOY2 106 aa6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 IGLC3P0DOY3 106 aa6.46□□□□□ -1.37
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