RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SPTBN2O15020 2390 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FAM166BA8MTA8 275 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 F2Z2F3 143 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5G3P48201 142 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 Q0VFX4 171 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 OR10D3Q8NH80 312 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 OR6C6A6NF89 314 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TCL1AP56279 114 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SERF2P84101 59 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 HIST3H3Q16695 136 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CLN8Q9UBY8 286 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 WIPI2Q9Y4P8 454 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 MED13Q9UHV7 2174 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0U1RQV5 110 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CCL25O15444 150 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ACSM6Q6P461 480 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RNF138Q8WVD3 245 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF488Q96MN9 340 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 WDR54Q9H977 334 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 DEPPQ9NTK1 212 aa13.76□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CACNA1GO43497 2377 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PINLYPA6NC86 204 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SNURFLB1AK76 121 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SH2D1BO14796 132 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 IGHEP01854 428 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SRP14P37108 136 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 GPM6AP51674 278 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RBM11P57052 281 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RAC1P63000 192 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 C3AR1Q16581 482 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 GPR35Q9HC97 309 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 DOCK10Q96BY6 2186 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CELA3AP09093 270 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 BCL3P20749 454 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 UCP1P25874 307 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CACNA1HO95180 2353 aa13.75□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CEP250Q9BV73 2442 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 COX5AP20674 150 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM211Q6ICI0 200 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 NAT8BQ9UHF3 227 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LOXL2Q9Y4K0 774 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CLDN15P56746 228 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 DCAF12Q5T6F0 453 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FAM19A2Q8N3H0 131 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SSC4DQ8WTU2 575 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 USF3Q68DE3 2245 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 GCSAMLQ5JQS6 135 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 WNT5BQ9H1J7 359 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TECTAO75443 2155 aa13.74□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LNP1A1A4G5 178 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 DSPP15924 2871 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM250H0YL14 139 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 M0QZ24 198 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CER1O95813 267 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A6P12236 298 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 SOX8P57073 446 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZPA2 131 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CT55Q8WUE5 264 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 VAMP5O95183 116 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DS4P43632 304 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PDLIM4P50479 330 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TFF3Q07654 80 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 KIR2DS1Q14954 304 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB123Q8N688 67 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF114Q8NC26 417 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf1Q9H5F2 150 aa13.73□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CYB561P49447 251 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PSG4Q00888 419 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 IGFBP7Q16270 282 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 OR10P1Q8NGE3 313 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 OR10G8Q8NGN5 311 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 OR1F12Q8NHA8 337 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM54Q969K7 222 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FOXB1Q99853 325 aa13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146 ms