RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.67□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa11.67□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.67□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.67□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 WNT9BO14905 357 aa11.67□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 PLCE1Q9P212 2302 aa11.67□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 M0R143 59 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 CER1O95813 267 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 HAND1O96004 215 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 WNT5AP41221 380 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 TCF23Q7RTU1 214 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 IMMP2LQ96T52 175 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 PRDM14Q9GZV8 571 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 TRAV24A0A0B4J272 114 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 PPIHO43447 177 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 AGFG2O95081 481 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 IER3P46695 156 aa11.66□□□□□ -0.54
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SGMS1-203ENST00000429490 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 SSC4DQ8WTU2 575 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 A0A1B0GUS0 222 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 PINLYPA6NC86 204 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 MT-CO2P00403 227 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 IGHEP01854 428 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 CRISP2P16562 243 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 SLC25A40Q8TBP6 338 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.66□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 CD46P15529 392 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 ATP5G3P48201 142 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 PRR27Q6MZM9 219 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 ODAMA1E959 279 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 H0Y8G0 127 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 DNPH1O43598 174 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 PAX9P55771 341 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 OR8G5Q8NG78 346 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 OR2M7Q8NG81 312 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 P2RX4Q99571 388 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 VAMP8Q9BV40 100 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 IL36GQ9NZH8 169 aa11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SGMS1-203ENST00000429490 IFITM10A6NMD0 228 aa11.65□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 NAPSAO96009 420 aa11.65□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 IGKV1-5P01602 117 aa11.65□□□□□ -0.55
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SGMS1-203ENST00000429490 SSTR5P35346 364 aa11.65□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 MIC13Q5XKP0 118 aa11.65□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ACSM6Q6P461 480 aa11.65□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.65□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 R3HDM4Q96D70 268 aa11.65□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.65□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa11.64□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FGF5P12034 268 aa11.64□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 CBLN1P23435 193 aa11.64□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 HES3Q5TGS1 186 aa11.64□□□□□ -0.55
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SGMS1-203ENST00000429490 TRIB1Q96RU8 372 aa11.64□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 DCTN5Q9BTE1 182 aa11.64□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 MANBALQ9NQG1 85 aa11.64□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ABCA4P78363 2273 aa11.64□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 C1QTNF9P0C862 333 aa11.64□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 CRIP3Q6Q6R5 217 aa11.64□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 SSX7Q7RTT5 188 aa11.64□□□□□ -0.55
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SGMS1-203ENST00000429490 C17orf98A8MV24 154 aa11.64□□□□□ -0.55
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SGMS1-203ENST00000429490 AMTP48728 403 aa11.64□□□□□ -0.55
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SGMS1-203ENST00000429490 S1PR3Q99500 378 aa11.64□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 MED13Q9UHV7 2174 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 CD1BP29016 333 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 MEOX1P50221 254 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TPPP2P59282 170 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM42Q69YG0 159 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 ABHD12Q8N2K0 398 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 OR4P4Q8NGL7 312 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A10PA6NDY2 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A18PA6NE21 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A16PA6NEW6 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A7PA6NKC0 464 aa11.63□□□□□ -0.55
SGMS1-203ENST00000429490 FAM90A22PA8MWA6 464 aa11.63□□□□□ -0.55
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