RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411092.1

RNU6-55P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 55, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-55P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-55P-201ENST00000411092 CHST1O43916 411 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 PDE6DO43924 150 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 SCRG1O75711 98 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 CST7O76096 145 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM50AO95807 157 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGKV1D-12P01611 117 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGHEP01854 428 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 AMBPP02760 352 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 PFN1P07737 140 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 GZMBP10144 247 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 OMGP23515 440 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 SSR4P51571 173 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 PAX9P55771 341 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 RANP62826 216 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF154Q13106 437 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 IL11RAQ14626 422 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 SLC10A1Q14973 349 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 BSXQ3C1V8 233 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 PIGYQ3MUY2 71 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ACTL10Q5JWF8 245 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAET1LQ5VY80 246 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF774Q6NX45 483 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF880Q6PDB4 577 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 BTNL3Q6UXE8 466 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 AAED1Q7RTV5 226 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF573Q86YE8 665 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF525Q8N782 197 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZIC4Q8N9L1 334 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 WDR31Q8NA23 367 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR5A2Q8NGI9 324 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR51G1Q8NGK1 321 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR11L1Q8NGX0 322 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR4X1Q8NH49 305 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR10J5Q8NHC4 309 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ABHD5Q8WTS1 349 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 RAB1CQ92928 201 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 NAT6Q93015 286 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ADGRG7Q96K78 797 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 SMIM7Q9BQ49 75 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZPBPQ9BS86 351 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM147Q9BVK8 224 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 LINC00470Q9BZP3 86 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 WNT5BQ9H1J7 359 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM9BQ9NQ34 198 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 KCNIP2Q9NS61 270 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 RPRMQ9NS64 109 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 TAAR3PQ9P1P4 343 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 OR14J1Q9UGF5 321 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 PROCRQ9UNN8 238 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 LAMP3Q9UQV4 416 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 CACNA1EQ15878 2313 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 A0A1B0GV50 99 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 XKRY2A2RUG3 117 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 C5orf63A6NC05 138 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 SHISA7A6NL88 538 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 TMEM210A6NLX4 147 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZFP92A6NM28 416 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF716A6NP11 495 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 CD300LBA8K4G0 201 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 CEBPZOSA8MTT3 80 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 B4E171 279 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 M0R143 59 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZIC3O60481 467 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 CYTIPO60759 359 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 MPDU1O75352 247 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF737O75373 536 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 SYNGR4O95473 234 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 FGF5P12034 268 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ZNF32P17041 273 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 COX5AP20674 150 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ANOS1P23352 680 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 ARR3P36575 388 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 TSPAN7P41732 249 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 GALR1P47211 349 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-55P-201ENST00000411092 TNFSF10P50591 281 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms