RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	AZIN1	O14977	448 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SPDEF	O95238	335 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CALCB	P10092	127 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PLET1	Q6UQ28	207 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CYS1	Q717R9	158 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	OAF	Q86UD1	273 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	THAP1	Q9NVV9	213 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ING4	Q9UNL4	249 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440		E7ESA3	106 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440		M0QYG6	137 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CHEK1	O14757	476 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PITX3	O75364	302 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC3B	P05452	202 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	IFI30	P13284	250 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR183	P32249	361 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFSF8	P32971	234 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TAS2R41	P59536	307 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TPRXL	Q17RH7	258 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF5	Q99942	180 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TM2D2	Q9BX73	214 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	GNG12	Q9UBI6	72 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SMPX	Q9UHP9	88 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RABAC1	Q9UI14	185 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPB6	O14558	160 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	BCL3	P20749	454 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	S100A3	P33764	101 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF134	P52741	427 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	FCN2	Q15485	313 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	KISS1	Q15726	138 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	COMMD2	Q86X83	199 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	NRM	Q8IXM6	262 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	CHST4	Q8NCG5	386 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	ARL11	Q969Q4	196 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	RFT1	Q96AA3	541 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5H14	A6NHG9	310 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440		J3QRK9	145 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440		K7EMT4	169 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	EBAG9	O00559	213 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINB7	O75635	380 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	CD5	P06127	495 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF688	P0C7X2	276 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	PSKH1	P11801	424 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	OPRL1	P41146	370 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	NAA20	P61599	178 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	FHL1	Q13642	323 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC63	Q8NA47	563 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM63	Q969Q1	353 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	TESC	Q96BS2	214 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		3.83	□□□□□ -1.8

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