RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM90A26D6RGX4 464 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 NEURL1O76050 574 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 P2RX4Q99571 388 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CEACAM18A8MTB9 384 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 AWAT1Q58HT5 328 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM255AQ5JRV8 349 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM57AQ8TBR7 257 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ID1P41134 155 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CRYBA2P53672 197 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 VWA1Q6PCB0 445 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FGFRL1Q8N441 504 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf172C9J069 976 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PDLIM4P50479 330 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 P2RY4P51582 365 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SDK2Q58EX2 2172 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LIPFP07098 398 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LOXL3P58215 753 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LAIR2Q6ISS4 152 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00114Q6XXX2 140 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 C16orf82Q7Z2V1 217 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SCNM1Q9BWG6 230 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PSME4Q14997 1843 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 DEDDO75618 318 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ORM1P02763 201 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 NPBWR2P48146 333 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 NHLH2Q02577 135 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4A5Q8NH83 315 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM186Q96B77 213 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UFC1Q9Y3C8 167 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CECR9P0C854 216 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RIGQ13278 110 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM87AP0C7U9 286 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 USF1P22415 310 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 OR10J1P30954 320 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ABHD12Q8N2K0 398 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 IL22RA2Q969J5 263 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PAXXQ9BUH6 204 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SMDT1Q9H4I9 107 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LOC105371242A0A075B767 164 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PHOX2AO14813 284 aa13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 OTOFQ9HC10 1997 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 GLIPR1P48060 266 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PTTG1IPP53801 180 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 ARF6P62330 175 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM27E3Q08E93 113 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 DCAF12L2Q5VW00 463 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPM7Q96QT4 1865 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXH1O75593 365 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SNCGO76070 127 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 IQCJQ1A5X6 159 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 RSRP1Q9BUV0 290 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PXMP4Q9Y6I8 212 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM74A7A6NL05 159 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35E4Q6ICL7 350 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PCSK4Q6UW60 755 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC01560Q8TB33 94 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM204Q9BSN7 226 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC7AQ9BXN2 247 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 DLL1O00548 723 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 MFNGO00587 321 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PF4V1P10720 104 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CD40P25942 277 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UCP3P55916 312 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 DNM1P46Q6ZS02 220 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 OVCH2Q7RTZ1 564 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 MEGF10Q96KG7 1140 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CACNA1GO43497 2377 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 PATJQ8NI35 1801 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0G2JMM0 328 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PPB8 328 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PRS3 328 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 KIR3DP1A8MWS1 328 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 VAMP8Q9BV40 100 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM140Q9NV12 185 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 TUBD1Q9UJT1 453 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A17O43808 307 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SMPD2O60906 423 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC119Q13432 240 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 SRD5A3Q9H8P0 318 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 CHODLQ9H9P2 273 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 LCTP09848 1927 aa13.96□□□□□ -0.17
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT5AP41221 380 aa13.96□□□□□ -0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TCL1AP56279 114 aa13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms